RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 SMIM10Q96HG1 83 aa21.15■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 KLHL31Q9H511 634 aa21.15■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 WDR54Q9H977 334 aa21.15■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 EMCNQ9ULC0 261 aa21.15■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 CDC14AQ9UNH5 594 aa21.15■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 C4orf51C9J302 202 aa21.14■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa21.14■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 STX16O14662 325 aa21.14■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 FFAR3O14843 346 aa21.14■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 GPR42O15529 346 aa21.14■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 DNAJB6O75190 326 aa21.14■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 CDH16O75309 829 aa21.14■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 NSA2O95478 260 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 B3GALT4O96024 378 aa21.14■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 CD63P08962 238 aa21.14■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 SLC35G6P0C7Q6 338 aa21.14■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 IL1RNP18510 177 aa21.14■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 IRF8Q02556 426 aa21.14■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 SSPNQ14714 243 aa21.14■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 VWA2Q5GFL6 755 aa21.14■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D19Q8N5T2 526 aa21.14■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 TRPV3Q8NET8 790 aa21.14■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa21.14■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 STT3BQ8TCJ2 826 aa21.14■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 KCNMB2Q9Y691 235 aa21.14■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 H0YIG0 161 aa21.13■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 SERPINA6P08185 405 aa21.13■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 GSTA1P08263 222 aa21.13■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 EPB42P16452 691 aa21.13■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 FBLP22087 321 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 EFNA3P52797 238 aa21.13■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 BORAQ6PGQ7 559 aa21.13■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa21.13■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 LAPTM4BQ86VI4 370 aa21.13■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 KRT78Q8N1N4 520 aa21.13■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 WBP1Q96G27 269 aa21.13■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 EFCAB11Q9BUY7 163 aa21.13■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 RHBGQ9H310 441 aa21.13■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB26Q9HCK0 441 aa21.13■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 TMCO1Q9UM00 188 aa21.13■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 POLHQ9Y253 713 aa21.13■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 PADI2Q9Y2J8 665 aa21.13■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa21.13■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 BSNQ9UPA5 3926 aa21.12■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 A8MT66 165 aa21.12■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 SGK494L7N484 410 aa21.12■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 OR7A17O14581 309 aa21.12■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 SERPIND1P05546 499 aa21.12■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 ZGLP1P0C6A0 271 aa21.12■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 FOLR3P41439 243 aa21.12■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 SLC18A2Q05940 514 aa21.12■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 GTF2H2Q13888 395 aa21.12■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa21.12■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa21.12■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 LAS2Q8IYD9 372 aa21.12■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 THAP4Q8WY91 577 aa21.12■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa21.12■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 TGIF2Q9GZN2 237 aa21.12■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 DCDC2Q9UHG0 476 aa21.12■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 PCTPQ9UKL6 214 aa21.12■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 TLDC2A0PJX2 215 aa21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 LRIT2A6NDA9 550 aa21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 DLX3O60479 287 aa21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 SMIM24O75264 130 aa21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 KLHL18O94889 574 aa21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 TUBBP07437 444 aa21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 RPS17P08708 135 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 ALOX12P18054 663 aa21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 KRT15P19012 456 aa21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 AVPR1BP47901 424 aa21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 KLC1Q07866 573 aa21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 RGS1Q08116 209 aa21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 LAPTM5Q13571 262 aa21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 ADPRMQ3LIE5 342 aa21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 SEC16BQ96JE7 1060 aa21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 MESP1Q9BRJ9 268 aa21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 TMEM109Q9BVC6 243 aa21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 IPPKQ9H8X2 491 aa21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 TRPC4Q9UBN4 977 aa21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 LGALS13Q9UHV8 139 aa21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms