RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580861.1

LINC00511-210, long intergenic non-protein coding RNA 511, humanhuman

TSL 4

Gene LINC00511, Length 467 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00511-210ENST00000580861 TBCCQ15814 346 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 UNC50Q53HI1 259 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ATG9BQ674R7 924 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 CEACAM20Q6UY09 585 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ZYG11AQ6WRX3 759 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 PPP1R3BQ86XI6 285 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 PLD3Q8IV08 490 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ANKRD53Q8N9V6 530 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 MFSD9Q8NBP5 474 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 C10orf82Q8WW14 230 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 PHF21BQ96EK2 531 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 THAP11Q96EK4 314 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 L3HYPDHQ96EM0 354 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 TMEM237Q96Q45 408 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 NPHS2Q9NP85 383 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 SAR1AQ9NR31 198 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 THSD1Q9NS62 852 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ABCF3Q9NUQ8 709 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 THAP1Q9NVV9 213 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ZNF225Q9UK10 706 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 PCTPQ9UKL6 214 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 AK5Q9Y6K8 562 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 CACNA1GO43497 2377 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 USP24Q9UPU5 2620 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 A0A1B0GTL3 188 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 TRBC2A0A5B9 178 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 FEZF1A0PJY2 475 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 TMEM114B3SHH9 223 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 PPP6CO00743 305 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 OR7A17O14581 309 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ZNF749O43361 778 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 OR2B3O76000 313 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 STK17BO94768 372 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 UBOX5O94941 541 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ONECUT2O95948 504 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 S100BP04271 92 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 SERPINE1P05121 402 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 GNAZP19086 355 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 IMPDH1P20839 514 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 BGNP21810 368 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 CD82P27701 267 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 HK2P52789 917 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 EMP3P54852 163 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ITGA1P56199 1179 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 DNAJB13P59910 316 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 HERVK_113P63132 956 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 DOC2AQ14183 400 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 MAP7Q14244 749 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 CHI3L2Q15782 390 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 GALNTL6Q49A17 601 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ZNF678Q5SXM1 525 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 CGB2Q6NT52 195 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 TLDC1Q6P9B6 456 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 TMPRSS11BQ86T26 416 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ZFAND4Q86XD8 727 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 KIRREL3Q8IZU9 778 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 TEX9Q8N6V9 391 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 L3MBTL4Q8NA19 623 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 OR6Y1Q8NGX8 325 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 CREB3L4Q8TEY5 395 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 FGF11Q92914 225 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 MOCOSQ96EN8 888 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 C10orf90Q96M02 699 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 LRFN5Q96NI6 719 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ERVK-6Q9BXR3 956 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 AICDAQ9GZX7 198 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 NT5DC2Q9H857 520 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 OXSMQ9NWU1 459 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 OPTCQ9UBM4 332 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ZFP69BQ9UJL9 534 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 SERTAD3Q9UJW9 196 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms