RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 B4GALT5O43286 388 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ADAM11O75078 769 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CILPO75339 1184 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 JRKO75564 520 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ENDOD1O94919 500 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 AP3S2P59780 193 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP6.13□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CARD16Q5EG05 197 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CDC73Q6P1J9 531 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CNTD1Q8N815 330 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ACBD4Q8NC06 268 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 C1orf54Q8WWF1 131 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.13□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 CA14Q9ULX7 337 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GSAPA4D1B5 854 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CLDN4O14493 209 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 BHLHE40O14503 412 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TGOLN2O43493 480 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 LRCH4O75427 683 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 APOC2P02655 101 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 JMJD7P0C870 316 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 NELFEP18615 380 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 HTR2AP28223 471 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 HPCAL1P37235 193 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TMBIM6P55061 237 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 MTX3Q5HYI7 312 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 Q5PR19 223 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PRMT9Q6P2P2 845 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 OR7G2Q8NG99 324 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 HDAC10Q969S8 669 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RCN3Q96D15 328 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 C9orf72Q96LT7 481 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CRB3Q9BUF7 120 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 STRA6Q9BX79 667 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 DGCR6LQ9BY27 220 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ASB8Q9H765 288 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF696Q9H7X3 374 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ACTR8Q9H981 624 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 B4E171 279 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF185O15231 689 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 LGI1O95970 557 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 HBQ1P09105 142 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 KITP10721 976 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 THRBP10828 461 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF30P17039 623 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SOAT1P35610 550 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ACTR1AP61163 376 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 WDR5P61964 334 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 IL10RBQ08334 325 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 UGCGQ16739 394 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 USP51Q70EK9 711 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SLC26A9Q7LBE3 791 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PDSS2Q86YH6 399 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CDK20Q8IZL9 346 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TXNDC15Q96J42 360 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TSGA13Q96PP4 275 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SGK2Q9HBY8 427 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SERHLQ9NQF3 203 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 POMT1Q9Y6A1 747 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 MCIDASD6RGH6 385 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 M0QZK8 103 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PMM2O15305 246 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF35P13682 527 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 FASP25445 335 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 HMGCLP35914 325 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TLE4Q04727 773 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PYDC2Q56P42 97 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.12□□□□□ -1.43
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