RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	SERPINA7	P05543	415 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	ICAM2	P13598	275 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	CXCR2	P25025	360 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	GGT5	P36269	586 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	GP5	P40197	560 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	SCTR	P47872	440 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	GPX6	P59796	221 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	AP2B1	P63010	937 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	GUCY2D	Q02846	1103 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	C2orf54	Q08AI8	447 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	CSHL1	Q14406	222 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	HERC3	Q15034	1050 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	IQCK	Q8N0W5	287 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	KCT2	Q8NC54	265 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	NEIL2	Q969S2	332 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	RBBP8	Q99708	897 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	COPG2	Q9UBF2	871 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	VPS4A	Q9UN37	437 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	SCN2A	Q99250	2005 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	ALOX12B	O75342	701 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	HEXB	P07686	556 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	PRR35	P0CG20	571 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	SOX11	P35716	441 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	SLC6A12	P48065	614 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	EFNA3	P52797	238 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	PLTP	P55058	493 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	SKP1	P63208	163 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	MFAP5	Q13361	173 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	ZNF460	Q14592	562 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	PCOLCE	Q15113	449 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	SYT16	Q17RD7	645 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	PDSS2	Q86YH6	399 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	NT5C	Q8TCD5	201 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	C8orf44	Q96CB5	159 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	OR1F2P	Q96R84	312 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	CYTH2	Q99418	400 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	MFRP	Q9BY79	579 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	FFAR3	O14843	346 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	GPR42	O15529	346 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	OR1F1	O43749	312 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	PIAS1	O75925	651 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	KLHL18	O94889	574 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	SERPINA6	P08185	405 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-223	ENST00000551137	CD1D	P15813	335 aa		10.85	□□□□□ -0.67

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