RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537686.5

GGA3-201, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 4,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-201ENST00000537686 TNFP01375 233 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 PRKACGP22612 351 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 IL4RP24394 825 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 MNDAP41218 407 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 CLCN7P51798 805 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 NUDT6P53370 316 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 LAPTM4AQ15012 233 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 ZNF789Q5FWF6 425 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 NANOGP8Q6NSW7 305 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 PRR23BQ6ZRT6 265 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 HTRA1Q92743 480 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 IL17FQ96PD4 163 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 P2RY13Q9BPV8 354 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 TAPBPLQ9BX59 468 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 MTG2Q9H4K7 406 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 NANOGQ9H9S0 305 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 SPO11Q9Y5K1 396 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 IRAK3Q9Y616 596 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 DNAJC13O75165 2243 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 PRAMEF12O95522 483 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 C6orf47O95873 294 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 H1F0P07305 194 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 CTSAP10619 480 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 IQCCQ4KMZ1 466 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 ERMP1Q7Z2K6 904 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 NFKBIDQ8NI38 313 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 RANBP9Q96S59 729 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 CXCL16Q9H2A7 254 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 NEUROD4Q9HD90 331 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 DZANK1Q9NVP4 752 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 ZNF860A6NHJ4 632 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 DFNA5O60443 496 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 EIPR1Q53HC9 387 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 TCEAL8Q8IYN2 117 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 CHST14Q8NCH0 376 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 HHIPL1Q96JK4 782 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 SLC2A11Q9BYW1 496 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 LINC00597Q9H2U6 94 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 MARCH7Q9H992 704 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 ACSL5Q9ULC5 683 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 A0A0U1RQS6 177 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 A0A1W2PQU0 124 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 C9P02748 559 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 BCKDHAP12694 445 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 BPIP17213 487 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 FUT4P22083 530 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 ACRV1P26436 265 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 ABHD13Q7L211 337 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 ISCA2Q86U28 154 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 KBTBD6Q86V97 674 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 KCNC2Q96PR1 638 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 BOCQ9BWV1 1114 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 TXLNGYQ9BZA5 131 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 HCSTQ9UBK5 93 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 CDC14AQ9UNH5 594 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 A8MU76 341 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 SSNA1O43805 119 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 IDH3BO43837 385 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 ADAMTS4O75173 837 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 CLIC3O95833 236 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 LATS1O95835 1130 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 GSRP00390 522 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 FPR1P21462 350 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 SPINT3P49223 89 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 LBX1P52954 281 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 GHDCQ8N2G8 530 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 TRAM1L1Q8N609 369 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 DEFB119Q8N690 84 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 PACRGLQ8N7B6 248 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 FIBINQ8TAL6 211 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 RAB7BQ96AH8 199 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 SCRN2Q96FV2 425 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 KLHDC7BQ96G42 594 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 MTMR10Q9NXD2 777 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 UBE2QL1A1L167 161 aa9.73□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 TAF4O00268 1085 aa9.73□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 ECDO95905 644 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 XKP51811 444 aa9.73□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 RP1P56715 2156 aa9.73□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 ID2Q02363 134 aa9.73□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa9.73□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 SLC30A8Q8IWU4 369 aa9.73□□□□□ -0.85
GGA3-201ENST00000537686 TSPEARQ8WU66 669 aa9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms