RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 CREB3L4Q8TEY5 395 aa21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 USP7Q93009 1102 aa21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 ACPTQ9BZG2 426 aa21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 AICDAQ9GZX7 198 aa21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 KLHL31Q9H511 634 aa21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 OCIAD1Q9NX40 245 aa21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKMY1Q9P2S6 941 aa21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 PMS2P1A4D2B8 440 aa21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKDD1BA6NHY2 528 aa21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 GABRA4P48169 554 aa21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 AQP5P55064 265 aa21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 INHBCP55103 352 aa21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 D2HGDHQ8N465 521 aa21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 KCT2Q8NC54 265 aa21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC13A3Q8WWT9 602 aa21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 EBF4Q9BQW3 602 aa21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 DMRT3Q9NQL9 472 aa21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 ZFP69BQ9UJL9 534 aa21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 DCHS1Q96JQ0 3298 aa21.71■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM149AA5PLN7 773 aa21.71■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 HGSO14964 777 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 HDAC3O15379 428 aa21.71■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 B3GALT4O96024 378 aa21.71■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 ATXN8OSP0DMR3 200 aa21.71■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 UBE2E3Q969T4 207 aa21.71■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 C19orf60Q96EN9 201 aa21.71■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 F2RL3Q96RI0 385 aa21.71■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 DPYSL5Q9BPU6 564 aa21.71■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 RHBGQ9H310 441 aa21.71■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A0G2JN53 185 aa21.7■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM150CB9EJG8 249 aa21.7■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 CHEK2O96017 543 aa21.7■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 MT-CO3P00414 261 aa21.7■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 CCL4P13236 92 aa21.7■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 CEACAM1P13688 526 aa21.7■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 EPHA3P29320 983 aa21.7■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 FOXM1Q08050 763 aa21.7■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 DTWD1Q8N5C7 304 aa21.7■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 SARGQ9BW04 601 aa21.7■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 NT5DC2Q9H857 520 aa21.7■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 IRAK4Q9NWZ3 460 aa21.7■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC12A4Q9UP95 1085 aa21.7■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa21.7■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A0G2JND7 137 aa21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 DIAPH2O60879 1101 aa21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNK5O95279 499 aa21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD34CP0C6C1 535 aa21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 WASHC2DQ5SRD0 308 aa21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 CDCP2Q5VXM1 449 aa21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 Q6ZSR9 355 aa21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 ASPGQ86U10 573 aa21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 TBC1D19Q8N5T2 526 aa21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 REPS1Q96D71 796 aa21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNK13Q9HB14 408 aa21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 C4orf51C9J302 202 aa21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 MAP3K7O43318 606 aa21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 CSO75390 466 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 HYAL2Q12891 473 aa21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 NAA25Q14CX7 972 aa21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 ISXQ2M1V0 245 aa21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 CPLX4Q7Z7G2 160 aa21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 CSNK1A1LQ8N752 337 aa21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 WDR48Q8TAF3 677 aa21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 OR6C1Q96RD1 312 aa21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 CTRCQ99895 268 aa21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 EPN3Q9H201 632 aa21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 APMAPQ9HDC9 416 aa21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 FGF21Q9NSA1 209 aa21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 PLCL2Q9UPR0 1127 aa21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 CCL27Q9Y4X3 112 aa21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 EFCAB7A8K855 629 aa21.68■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 RTCAO00442 366 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.062e-6■■■□□ 18.4
TSNARE1-208ENST00000524325 AHRP35869 848 aa21.68■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa21.68■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 CARFQ8N187 725 aa21.68■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa21.68■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 OR1L3Q8NH93 324 aa21.68■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa21.68■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 OR52B2Q96RD2 323 aa21.68■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIM55Q9BYV6 548 aa21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms