RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 PAGE2Q7Z2X7 111 aa23.51■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa23.51■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF438Q7Z4V0 828 aa23.51■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 FUNDC1Q8IVP5 155 aa23.51■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM20CQ8IXL6 584 aa23.51■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa23.51■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 PROKR1Q8TCW9 393 aa23.51■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 RSC1A1Q92681 617 aa23.51■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 RAB33BQ9H082 229 aa23.51■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 OR51B5Q9H339 312 aa23.51■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 GAREM1Q9H706 876 aa23.51■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 LRIT1Q9P2V4 623 aa23.51■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 NDUFAF1Q9Y375 327 aa23.51■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 ARHGAP33O14559 1287 aa23.5■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 ANKRD28O15084 1053 aa23.5■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 ANGPT2O15123 496 aa23.5■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 KRT16P08779 473 aa23.5■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 GIMD1P0DJR0 217 aa23.5■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 TYRP1P17643 537 aa23.5■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 SDC1P18827 310 aa23.5■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 RAP1GDS1P52306 607 aa23.5■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 CLDN8P56748 225 aa23.5■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 FIGLAQ6QHK4 219 aa23.5■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 ARHGAP24Q8N264 748 aa23.5■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 OR4C6Q8NH72 309 aa23.5■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 SPDL1Q96EA4 605 aa23.5■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 SEMA6CQ9H3T2 930 aa23.5■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 TAS2R1Q9NYW7 299 aa23.5■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa23.5■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 CACNA1EQ15878 2313 aa23.49■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 TNFRSF10AO00220 468 aa23.49■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 NRP2O60462 931 aa23.49■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 CYP4F2P78329 520 aa23.49■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 ART3Q13508 389 aa23.49■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 PTGR1Q14914 329 aa23.49■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 NR1D2Q14995 579 aa23.49■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 C16orf89Q6UX73 402 aa23.49■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 RINLQ6ZS11 566 aa23.49■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 TRIM73Q86UV7 250 aa23.49■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC35F3Q8IY50 421 aa23.49■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 CREB3L4Q8TEY5 395 aa23.49■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 CD180Q99467 661 aa23.49■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 MCM8Q9UJA3 840 aa23.49■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 RNF215Q9Y6U7 377 aa23.49■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 A0A1W2PP18 115 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 CCDC154A6NI56 674 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 PRR33A8MZF0 331 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 PCDH7O60245 1069 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 PRPS1L1P21108 318 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 GSTM5P46439 218 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 NUDT2P50583 147 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 CORO7P57737 925 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 C21orf58P58505 322 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 GPLD1P80108 840 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 ZIC1Q15915 447 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 DPY19L1Q2PZI1 675 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 COMMD6Q7Z4G1 85 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 PLD3Q8IV08 490 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 RGMAQ96B86 450 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 RCN3Q96D15 328 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 ACTL8Q9H568 366 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 EPHA6Q9UF33 1036 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 ADAM29Q9UKF5 820 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 AIM2O14862 343 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 CFLARO15519 480 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 NDUFS4O43181 175 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 IL6P05231 212 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 PNLIPP16233 465 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 MPLP40238 635 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 RGS1Q08116 209 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 TGM3Q08188 693 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 PWP1Q13610 501 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 KMT2EQ8IZD2 1858 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 CARFQ8N187 725 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM181AQ8N9Y4 354 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 MCUR1Q96AQ8 359 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 ZDHHC12Q96GR4 267 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 CLMPQ9H6B4 373 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 C1GALT1Q9NS00 363 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 TTC28Q96AY4 2481 aa23.47■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa23.47■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 ANKRD65E5RJM6 399 aa23.47■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 CDH3P22223 829 aa23.47■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF763Q0D2J5 394 aa23.47■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 NR0B2Q15466 257 aa23.47■■□□□ 1.35
ECHDC3-201ENST00000379215 REP15Q6BDI9 236 aa23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.9 ms