RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	PDSS2	Q86YH6	399 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC138	Q96M89	665 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	CYTH2	Q99418	400 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	KLHL1	Q9NR64	748 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338		E5RI56	91 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM227A	F5H4B4	570 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338		H0YIG0	161 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	SGK494	L7N484	410 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	TXNDC9	O14530	226 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	AVIL	O75366	819 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	AVPR1B	P47901	424 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNJ1	P48048	391 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	TERF1	P54274	439 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	AP2B1	P63010	937 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ABAT	P80404	500 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	RBPJ	Q06330	500 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	OR1C1	Q15619	314 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	CCNG2	Q16589	344 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	LONRF1	Q17RB8	773 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	SIAH3	Q8IW03	269 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	PRELID2	Q8N945	189 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ASB11	Q8WXH4	323 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	SCMH1	Q96GD3	660 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	MAGED4	Q96JG8	741 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR137	Q96N19	417 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	FRMD6	Q96NE9	622 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	TCF12	Q99081	682 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ASPDH	A6ND91	283 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF839	A8K0R7	811 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	GFY	I3L273	518 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	RDH16	O75452	317 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	TPSB2	P20231	275 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	HSD17B2	P37059	387 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	CD96	P40200	585 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	BCL6	P41182	706 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	KIR3DL1	P43629	444 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	TBPL1	P62380	186 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	HSF1	Q00613	529 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	TPSAB1	Q15661	275 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	NDUFA9	Q16795	377 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	SPINK14	Q6IE38	97 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	NEPRO	Q6NW34	567 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	XKRX	Q6PP77	449 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	KCT2	Q8NC54	265 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	CD200R1	Q8TD46	325 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	TSLP	Q969D9	159 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	RBSN	Q9H1K0	784 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNK13	Q9HB14	408 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	MEMO1	Q9Y316	297 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ITPR3	Q14573	2671 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	FEZF1	A0PJY2	475 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	GABRR3	A8MPY1	467 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	TTI1	O43156	1089 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	NEURL1	O76050	574 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	CYC1	P08574	325 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms