RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566067.5

CENPT-222, Transcript of centromere protein T, human

TSL 3

Gene CENPT, Length 631 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CENPT-222	ENST00000566067	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	C12orf66	Q96MD2	445 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	HAUS8	Q9BT25	410 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	PISD	Q9UG56	409 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	VPS4A	Q9UN37	437 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	SNX6	Q9UNH7	406 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	KCNK6	Q9Y257	313 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	TMEM233	B4DJY2	109 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	OR7A17	O14581	309 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	SLC16A8	O95907	504 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	CAPN1	P07384	714 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	LBP	P18428	481 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	GNAZ	P19086	355 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	COL8A1	P27658	744 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	IMPA1	P29218	277 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	EPHA3	P29320	983 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	HNF4A	P41235	474 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	GDF5	P43026	501 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	STX1B	P61266	288 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	PCDH1	Q08174	1060 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	BNIP1	Q12981	228 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	TRAF3	Q13114	568 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	TUBB3	Q13509	450 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	GALNTL6	Q49A17	601 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	HID1	Q8IV36	788 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	OR13H1	Q8NG92	308 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	NAT6	Q93015	286 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	PRR19	A6NJB7	356 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	OR5K4	A6NMS3	321 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067		E9PBE3	544 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	SLC28A1	O00337	649 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	PIP5K1B	O14986	540 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	UBD	O15205	165 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	RGS14	O43566	566 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	KLHL41	O60662	606 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	ULK1	O75385	1050 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	CTSE	P14091	401 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	CALB2	P22676	271 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	PRDX6	P30041	224 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	ATP4B	P51164	291 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	PDX1	P52945	283 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	IRF8	Q02556	426 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	LAPTM5	Q13571	262 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	ALG11	Q2TAA5	492 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	PERM1	Q5SV97	790 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	PARG	Q86W56	976 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	ZNF480	Q8WV37	535 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	UBE2E3	Q969T4	207 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	REPS1	Q96D71	796 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	PDXP	Q96GD0	296 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	NSL1	Q96IY1	281 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	OR52B2	Q96RD2	323 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	ASB1	Q9Y576	335 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	PPP6C	O00743	305 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	FUCA1	P04066	466 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	ACTR1B	P42025	376 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	ACTR1A	P61163	376 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	CHIT1	Q13231	466 aa		13.42	□□□□□ -0.26

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