RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 CTAG2O75638 210 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 TPM1P09493 284 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 ERGP11308 486 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 TFEBP19484 476 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 IL10P22301 178 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 XCR1P46094 333 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 EFNA3P52797 238 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 DGKQP52824 942 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 ABATP80404 500 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 TSTD2Q5T7W7 516 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 MEI1Q5TIA1 1274 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 ICE2Q659A1 982 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 ZNF425Q6IV72 752 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 ADCK2Q7Z695 626 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 LRRC6Q86X45 466 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 KRT222Q8N1A0 295 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 OR13J1Q8NGT2 312 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 OR9A1PQ8NGU1 263 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 PEX13Q92968 403 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 DNAJC7Q99615 494 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 SARGQ9BW04 601 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 OSBPL8Q9BZF1 889 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 FAM114A2Q9NRY5 505 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 SPTLC3Q9NUV7 552 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 NFS1Q9Y697 457 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-228ENST00000551473 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 GTF3C1Q12789 2109 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 A0A0U1RQJ8 604 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 FAM171A2A8MVW0 826 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 KIF5CO60282 957 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 TJP3O95049 919 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 ADRA1DP25100 572 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 ATP5DP30049 168 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 PTPN7P35236 360 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 MEOX1P50221 254 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 SLC26A5P58743 744 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 ADAM8P78325 824 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 PMPCAQ10713 525 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 USP10Q14694 798 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 NSDHLQ15738 373 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 CCSMST1Q4G0I0 132 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 CCDC38Q502W7 563 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 SFT2D3Q587I9 215 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 RNFT1Q5M7Z0 435 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 C11orf63Q6NUN7 778 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 PLPP5Q8NEB5 264 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 OR5M3Q8NGP4 307 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 OR9A4Q8NGU2 314 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 C16orf52Q8NHV5 167 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 MBD6Q96DN6 1003 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 SEC16BQ96JE7 1060 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 ANKHQ9HCJ1 492 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 CATSPERZQ9NTU4 200 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 TAC3Q9UHF0 121 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 MAGEB17A8MXT2 336 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 HS6ST1O60243 411 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 MAN1A2O60476 641 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 METTL18O95568 372 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.621e-6■■■■□ 26.3
CS-228ENST00000551473 HRH2P25021 359 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 BCL6P41182 706 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 MARCKSL1P49006 195 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 HLCSP50747 726 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 NUP107P57740 925 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 OR4D2P58180 307 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 MPP1Q00013 466 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 ACVR1Q04771 509 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 ABRAXAS2Q15018 415 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 SUSD1Q6UWL2 747 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 ZNF534Q76KX8 674 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 MPP5Q8N3R9 675 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 AMER2Q8N7J2 671 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 ACRBPQ8NEB7 543 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 ELP5Q8TE02 316 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 CREB3L4Q8TEY5 395 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 THAP11Q96EK4 314 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 C18orf12Q96KH6 178 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 OR1F2PQ96R84 312 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 PLSCR2Q9NRY7 297 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 ZNF358Q9NW07 568 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-228ENST00000551473 HCN3Q9P1Z3 774 aa11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms