RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	CPZ	Q66K79	652 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	IFT20	Q8IY31	132 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	TRPV3	Q8NET8	790 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	PYCR2	Q96C36	320 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	FAR2	Q96K12	515 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	FMO2	Q99518	471 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR22	Q99680	433 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	PELI2	Q9HAT8	420 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	CD274	Q9NZQ7	290 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP10	Q9P2G4	905 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	C3orf18	Q9UK00	162 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	ATRX	P46100	2492 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A087X1B8	175 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	ESYT3	A0FGR9	886 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	TTLL8	A6PVC2	850 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	CDC7	O00311	574 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	FANCG	O15287	622 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	NDUFS4	O43181	175 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	TSPAN12	O95859	305 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	CTSB	P07858	339 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	CYC1	P08574	325 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	GSTM2	P28161	218 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	AHR	P35869	848 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC26A3	P40879	764 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	CSNK1G2	P78368	415 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	KLC1	Q07866	573 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	LAPTM5	Q13571	262 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF460	Q14592	562 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	MYBPC3	Q14896	1274 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	SBSN	Q6UWP8	590 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	PLD3	Q8IV08	490 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	AGAP4	Q96P64	663 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	CTSF	Q9UBX1	484 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	ACOT9	Q9Y305	439 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	FEZF1	A0PJY2	475 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC189	A1A4V9	331 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	TP73	O15350	636 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	VPS4B	O75351	444 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	STK16	O75716	305 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	KRT38	O76015	456 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	WFS1	O76024	890 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	WISP1	O95388	367 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	HP	P00738	406 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	JAK1	P23458	1154 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	GCGR	P47871	477 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	SERPINB9	P50453	376 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	CSRP3	P50461	194 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	TLE1	Q04724	770 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	CDC16	Q13042	620 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	RCN2	Q14257	317 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	TGFBI	Q15582	683 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		10.77	□□□□□ -0.69

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