RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 CCNDBP1O95273 360 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ACSL3O95573 720 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 C2P06681 752 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 RHOXF2BP0C7M4 288 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SMIM10L1P0DMW3 83 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MTHFD2P13995 350 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CD22P20273 847 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SPRP35270 261 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC26A3P40879 764 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CCR10P46092 362 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC6A12P48065 614 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 HSPA7P48741 367 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 AGTR2P50052 363 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CCL11P51671 97 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 PMS2P54278 862 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ARSFP54793 590 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 AP1S2P56377 157 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB10P61026 200 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ABATP80404 500 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CDKL1Q00532 357 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MC1RQ01726 317 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 GRM7Q14831 915 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ADNP2Q6IQ32 1131 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ISCA2Q86U28 154 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 C17orf64Q86WR6 236 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 PDSS2Q86YH6 399 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 PRSS58Q8IYP2 241 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MFSD9Q8NBP5 474 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 FDCSPQ8NFU4 85 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ABHD11Q8NFV4 315 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 KCTD4Q8WVF5 259 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC44A1Q8WWI5 657 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD7Q92527 254 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CDKL2Q92772 493 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 KIAA1191Q96A73 305 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SMIM10Q96HG1 83 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR78Q96P69 363 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ATOH8Q96SQ7 321 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 FMO2Q99518 471 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 RHOXF2Q9BQY4 288 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SARGQ9BW04 601 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ING2Q9H160 280 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC25A18Q9H1K4 315 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 KLHL31Q9H511 634 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 POPDC3Q9HBV1 291 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF304Q9HCX3 659 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 A6NL46 340 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXO6A8MYZ6 492 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 B8ZZF3 427 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 C9J4A7 227 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SGK494L7N484 410 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 UBXN8O00124 270 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CEACAM4O75871 244 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR47O94967 919 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ALBP02768 609 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 TUBB4AP04350 444 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CELA2AP08217 269 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ANXA5P08758 320 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ZGLP1P0C6A0 271 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 PLA2G2AP14555 144 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 EZRP15311 586 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 STMN1P16949 149 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 IL1RNP18510 177 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 TFEBP19484 476 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 HIST1H2ADP20671 130 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 STX2P32856 288 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 GGT5P36269 586 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MAGEA12P43365 314 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SCTRP47872 440 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 REEP5Q00765 189 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 RELAQ04206 551 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 KLC1Q07866 573 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 Q0VFX4 171 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 RAPSNQ13702 412 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SLMAPQ14BN4 828 aa6.65□□□□□ -1.34
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