RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329151.5

TMEM54-201, Transcript of transmembrane protein 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM54, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54-201ENST00000329151 DNAJB8Q8NHS0 232 aa22.08■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 SLC30A3Q99726 388 aa22.08■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 FAM167BQ9BTA0 163 aa22.08■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 ANKHQ9HCJ1 492 aa22.08■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 SEC14L3Q9UDX4 400 aa22.08■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 PRAMEF2O60811 474 aa22.07■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 UNC5CO95185 931 aa22.07■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 NSA2O95478 260 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 CYC1P08574 325 aa22.07■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 IMPA1P29218 277 aa22.07■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 PTK6Q13882 451 aa22.07■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 ANKRD22Q5VYY1 191 aa22.07■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 C17orf64Q86WR6 236 aa22.07■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 MCUQ8NE86 351 aa22.07■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 GIMAP7Q8NHV1 300 aa22.07■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 THAP11Q96EK4 314 aa22.07■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 TAAR6Q96RI8 345 aa22.07■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 HCN3Q9P1Z3 774 aa22.07■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 GFYI3L273 518 aa22.06■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 MLYCDO95822 493 aa22.06■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 F7P08709 466 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 HIST1H2ADP20671 130 aa22.06■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 XCR1P46094 333 aa22.06■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 TBPL1P62380 186 aa22.06■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 TICAM1Q8IUC6 712 aa22.06■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 OR51Q1Q8NH59 317 aa22.06■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa22.06■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa22.06■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF354BQ96LW1 612 aa22.06■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 CCDC138Q96M89 665 aa22.06■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 SERPINB12Q96P63 405 aa22.06■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 HIST1H2AJQ99878 128 aa22.06■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 H2AFJQ9BTM1 129 aa22.06■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 VN1R1Q9GZP7 353 aa22.06■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 KCNK13Q9HB14 408 aa22.06■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 FBXO5Q9UKT4 447 aa22.06■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 SLC35G6P0C7Q6 338 aa22.05■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 IL1RNP18510 177 aa22.05■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 CCND1P24385 295 aa22.05■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 TNFRSF8P28908 595 aa22.05■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 AGTR2P50052 363 aa22.05■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 MYO1HQ8N1T3 1032 aa22.05■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 TBC1D19Q8N5T2 526 aa22.05■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 CD200R1Q8TD46 325 aa22.05■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 GRK7Q8WTQ7 553 aa22.05■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 RELTQ969Z4 430 aa22.05■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 CYTH2Q99418 400 aa22.05■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 FAM129AQ9BZQ8 928 aa22.05■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 SYNPO2LQ9H987 977 aa22.05■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 PCNX1Q96RV3 2341 aa22.05■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 CCL21O00585 134 aa22.04■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 C8GP07360 202 aa22.04■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 TDGF1P3P51864 188 aa22.04■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 SKP1P63208 163 aa22.04■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 MPP1Q00013 466 aa22.04■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa22.04■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF766Q5HY98 468 aa22.04■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF549Q6P9A3 640 aa22.04■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 ASPGQ86U10 573 aa22.04■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.04■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 PBKQ96KB5 322 aa22.04■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 IMMP1LQ96LU5 166 aa22.04■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 TAS2R13Q9NYV9 303 aa22.04■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa22.04■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa22.03■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa22.03■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa22.03■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa22.03■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 SGK494L7N484 410 aa22.03■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 TTI1O43156 1089 aa22.03■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 EXT1Q16394 746 aa22.03■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 PLAG1Q6DJT9 500 aa22.03■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 LANCL3Q6ZV70 420 aa22.03■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 TRIM54Q9BYV2 358 aa22.03■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 PARVBQ9HBI1 364 aa22.03■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 HAUS5O94927 633 aa22.02■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 COILP38432 576 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 BCL6P41182 706 aa22.02■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 TAS2R50P59544 299 aa22.02■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 SP140Q13342 867 aa22.02■■□□□ 1.12
TMEM54-201ENST00000329151 ART3Q13508 389 aa22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms