RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243103.3

HOXC12-201, Transcript of homeobox C12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC12, Length 3,335 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12-201ENST00000243103 HACD2Q6Y1H2 254 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 CRTAC1Q9NQ79 661 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 HCSTQ9UBK5 93 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 J3KR12 359 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 NDUFS3O75489 264 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 GPX5O75715 221 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 GDI2P50395 445 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 GPR19Q15760 415 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 SV2CQ496J9 727 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 MARCH8Q5T0T0 291 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 TMEM65Q6PI78 240 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 TAC4Q86UU9 113 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 C16orf70Q9BSU1 422 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 SH3BP5O60239 455 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 GLP2RO95838 553 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 CTRB1P17538 263 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 EPHA5P54756 1037 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 MFSD10Q14728 455 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 P2RY14Q15391 338 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 FCN2Q15485 313 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 CTRB2Q6GPI1 263 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 LETMD1Q6P1Q0 360 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 IL20RBQ6UXL0 311 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 KRT73Q86Y46 540 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 TTC9BQ8N6N2 239 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 TCF25Q9BQ70 676 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 DUSP21Q9H596 190 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 GLOD4Q9HC38 313 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 FANCFQ9NPI8 374 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 TMEM161AQ9NX61 479 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 GZMKP49863 264 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 RPS7P62081 194 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 CPZQ66K79 652 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 KCTD11Q693B1 232 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 KDELC1Q6UW63 502 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 DLEU7Q6UYE1 221 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 PRSS48Q7RTY5 328 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 ST8SIA4Q92187 359 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 ADAMDEC1O15204 470 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 NUDT7P0C024 238 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 C7P10643 843 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 AVPR1BP47901 424 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 DNAJB13P59910 316 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 MGAT3Q09327 533 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 LEXMQ3ZCV2 418 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 Q8N402 240 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 HERVK_113Q902F9 699 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 SMOQ99835 787 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 COLEC11Q9BWP8 271 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 MED28Q9H204 178 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 DOCK3Q8IZD9 2030 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 FAM234BA2RU67 622 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 EEDO75530 441 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 TIE1P35590 1138 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 DCDC1P59894 354 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 DSTNP60981 165 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 SLC14A1Q13336 389 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 C9orf131Q5VYM1 1079 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 ATAD1Q8NBU5 361 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 ZFAND1Q8TCF1 268 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 RIPOR3Q96MK2 946 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 TTLL2Q9BWV7 592 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 TBC1D17Q9HA65 648 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 DCLK1O15075 740 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 KCNJ13O60928 360 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 CD1DP15813 335 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 DRD5P21918 477 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 CDKN2CP42773 168 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 CLCN4P51793 760 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 OAZ1P54368 228 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 SLC6A19Q695T7 634 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 ZNF613Q6PF04 617 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 PTCHD4Q6ZW05 846 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 SZRD1Q7Z422 152 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 VWA5B2Q8N398 1253 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 MTMR14Q8NCE2 650 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms