RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622166.1

IGHV3-54-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-54 (pseudogene), humanhuman

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Gene IGHV3-54, Length 353 nt, Biotype IG V pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-54-201ENST00000622166 VWCEQ96DN2 955 aa9.3□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.3□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 C7orf34Q96L11 122 aa9.3□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 EPYCQ99645 322 aa9.3□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 DGCR6LQ9BY27 220 aa9.3□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM83DQ9H4H8 585 aa9.3□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa9.3□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 REEP1Q9H902 201 aa9.3□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 AKIP1Q9NQ31 210 aa9.3□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 CREBZFQ9NS37 354 aa9.3□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 EXD2Q9NVH0 621 aa9.3□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 IRAK4Q9NWZ3 460 aa9.3□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 ATP6V1HQ9UI12 483 aa9.3□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 ERVK-11Q9UQG0 969 aa9.3□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 GMPPBQ9Y5P6 360 aa9.3□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 U3KQV3 271 aa9.3□□□□□ -0.92
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IGHV3-54-201ENST00000622166 C1orf226A1L170 272 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 ARHGEF33A8MVX0 844 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 J3QRK9 145 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 hCG_2039718K7EN88 272 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 YY2O15391 372 aa9.29□□□□□ -0.92
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IGHV3-54-201ENST00000622166 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 C1QCP02747 245 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 FUCA1P04066 466 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 TFPTP0C1Z6 253 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 OCM2P0CE71 109 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 CTSAP10619 480 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 LAMP1P11279 417 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 IDSP22304 550 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 FMO3P31513 532 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 GRK3P35626 688 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 OPRL1P41146 370 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 BCAP31P51572 246 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 TEKQ02763 1124 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 ACSM2AQ08AH3 577 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 DGUOKQ16854 277 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 HKDC1Q2TB90 917 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 XKR6Q5GH73 641 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 MLIPQ5VWP3 458 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 ACSM2BQ68CK6 577 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 LILRA6Q6PI73 481 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 AGTRAPQ6RW13 159 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 GALNT5Q7Z7M9 940 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 CLECL1Q8IZS7 167 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 MINDY2Q8NBR6 621 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 CHST14Q8NCH0 376 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 HCAR2Q8TDS4 363 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZFP90Q8TF47 636 aa9.29□□□□□ -0.92
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IGHV3-54-201ENST00000622166 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
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IGHV3-54-201ENST00000622166 VPS35Q96QK1 796 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 HEPHQ9BQS7 1158 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 DUSP26Q9BV47 211 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 EBPLQ9BY08 206 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC46A2Q9BY10 475 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 GABARAPL3Q9BY60 117 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 ATG10Q9H0Y0 220 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 ABCG8Q9H221 673 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 TPT1P8Q9HAU6 139 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 ANKHQ9HCJ1 492 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 HMG20AQ9NP66 347 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 FBXO8Q9NRD0 319 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 GIN1Q9NXP7 522 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 PADI2Q9Y2J8 665 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa9.28□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 FUOMA2VDF0 154 aa9.28□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 GABRR3A8MPY1 467 aa9.28□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 UPK3BL1B0FP48 263 aa9.28□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 MYO1GB0I1T2 1018 aa9.28□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM229AB2RXF0 380 aa9.28□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 UPK3BL2E5RIL1 263 aa9.28□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 E7EQ34 232 aa9.28□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 NPC1O15118 1278 aa9.28□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 AXIN1O15169 862 aa9.28□□□□□ -0.92
IGHV3-54-201ENST00000622166 TGM5O43548 720 aa9.28□□□□□ -0.92
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