RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550261.5

PPP1CC-205, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, human

TSL 5

Gene PPP1CC, Length 747 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CC-205	ENST00000550261	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	LINC00523	Q86TU6	105 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	TRIM69	Q86WT6	500 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	ALLC	Q8N6M5	410 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	MNS1	Q8NEH6	495 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	MUL1	Q969V5	352 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	TADA1	Q96BN2	335 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	SCRN2	Q96FV2	425 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	FEM1C	Q96JP0	617 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	FAR2	Q96K12	515 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	DESI2	Q9BSY9	194 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	TRMO	Q9BU70	441 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	TRIM2	Q9C040	744 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	HACD3	Q9P035	362 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	PAK5	Q9P286	719 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	IL36A	Q9UHA7	158 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	RAB23	Q9ULC3	237 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	PTPRD	P23468	1912 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	CEP250	Q9BV73	2442 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	SGK1	O00141	431 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	DFFA	O00273	331 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	FTCD	O95954	541 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	CD160	O95971	181 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	JCHAIN	P01591	159 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	FGG	P02679	453 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	TUBB	P07437	444 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	CD48	P09326	243 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	SP9	P0CG40	484 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	TCF4	P15884	667 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	NPPB	P16860	134 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	CD72	P21854	359 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	PSMA3	P25788	255 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	CD27	P26842	260 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	TPMT	P51580	245 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	GEM	P55040	296 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	RHOA	P61586	193 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	GBE1	Q04446	702 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	KDSR	Q06136	332 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	CYTH1	Q15438	398 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	UGP2	Q16851	508 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	ACCSL	Q4AC99	568 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	CFAP58	Q5T655	872 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	PCGF5	Q86SE9	256 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PPP1CC-205	ENST00000550261	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms