RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 GDPD4Q6W3E5 623 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 Q6ZNX1 250 aa6.79□□□□□ -1.32
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HERC4-211ENST00000492996 AQP12AQ8IXF9 295 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 FAM47BQ8NA70 645 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 CYGBQ8WWM9 190 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ELMO1Q92556 727 aa6.79□□□□□ -1.32
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HERC4-211ENST00000492996 BIRC7Q96CA5 298 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 PPP3R2Q96LZ3 170 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ZBTB18Q99592 522 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 LRTM1Q9HBL6 345 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 HEBP1Q9NRV9 189 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 DMTF1Q9Y222 760 aa6.79□□□□□ -1.32
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HERC4-211ENST00000492996 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 TMEM202A6NGA9 273 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ANKRD28O15084 1053 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
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HERC4-211ENST00000492996 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
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HERC4-211ENST00000492996 ADIPOR2Q86V24 386 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 DTWD1Q8N5C7 304 aa6.79□□□□□ -1.32
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HERC4-211ENST00000492996 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 OR10A6Q8NH74 314 aa6.79□□□□□ -1.32
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HERC4-211ENST00000492996 ZNF597Q96LX8 424 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 PHOX2BQ99453 314 aa6.79□□□□□ -1.32
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HERC4-211ENST00000492996 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 FAM83DQ9H4H8 585 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ELOVL6Q9H5J4 265 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 IKZF5Q9H5V7 419 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 SPHK2Q9NRA0 654 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ANAPC2Q9UJX6 822 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 EI24O14681 340 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 TMCC2O75069 709 aa6.78□□□□□ -1.32
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HERC4-211ENST00000492996 PDYNP01213 254 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 HRH2P25021 359 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 TACR1P25103 407 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 GJA4P35212 333 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 BCAP31P51572 246 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 GRIK2Q13002 908 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 BCL2A1Q16548 175 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 PYCR3Q53H96 274 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 COQ5Q5HYK3 327 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
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HERC4-211ENST00000492996 METTL25Q8N6Q8 603 aa6.78□□□□□ -1.32
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HERC4-211ENST00000492996 ZFYVE19Q96K21 471 aa6.78□□□□□ -1.32
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HERC4-211ENST00000492996 ARMC1Q9NVT9 282 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 CCL27Q9Y4X3 112 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
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HERC4-211ENST00000492996 THADAQ6YHU6 1953 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 GSTA4O15217 222 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 KRT6AP02538 564 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 KRT6BP04259 564 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 BMP2P12643 396 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 BCKDHAP12694 445 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 EPORP19235 508 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
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