RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 VTI1BQ9UEU0 232 aa9.86□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ADGRE2Q9UHX3 823 aa9.86□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ADAM21Q9UKJ8 722 aa9.86□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa9.86□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LAMA1P25391 3075 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRBC2A0A5B9 178 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FFAR3O14843 346 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GPR42O15529 346 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ITM2AO43736 263 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR1F1O43749 312 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EDF1O60869 148 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CBFA2T3O75081 653 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ULK1O75385 1050 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C9P02748 559 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CAPN1P07384 714 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KITP10721 976 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EPORP19235 508 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SDHBP21912 280 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 VARSP26640 1264 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CSF2RBP32927 897 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCR10P46092 362 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ERVPABLB-1P60509 514 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PPP1CAP62136 330 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF33BQ06732 778 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IMPG1Q17R60 797 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CATSPEREQ5SY80 951 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PHF19Q5T6S3 580 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FRG2Q64ET8 278 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CPLX4Q7Z7G2 160 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PIP4P1Q86T03 277 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DDIASQ8IXT1 998 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF781Q8N8C0 355 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DEFB124Q8NES8 71 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SELENOMQ8WWX9 145 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 THAP11Q96EK4 314 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MOCOSQ96EN8 888 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SEC16BQ96JE7 1060 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM74Q96NL1 305 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FRG2BQ96QU4 278 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MAP3K3Q99759 626 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NUDT22Q9BRQ3 303 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRIM55Q9BYV6 548 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 STRADBQ9C0K7 418 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM107BQ9H098 131 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RIC8BQ9NVN3 520 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NMRK1Q9NWW6 199 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SH2B3Q9UQQ2 575 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RNF11Q9Y3C5 154 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRAF6Q9Y4K3 522 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KLK4Q9Y5K2 254 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR2A25A4D2G3 310 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GMNCA6NCL1 334 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 H0YIV9 168 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TXNDC9O14530 226 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HAT1O14929 419 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HDAC3O15379 428 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 WFS1O76024 890 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SERPIND1P05546 499 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FGF4P08620 206 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ANKRD34CP0C6C1 535 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC35G6P0C7Q6 338 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PVRP15151 417 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AHRP35869 848 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CSNK1G2P78368 415 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HSD11B2P80365 405 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RELAQ04206 551 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RGS1Q08116 209 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CYP4F3Q08477 520 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SGO1Q5FBB7 561 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KANK2Q63ZY3 851 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CLEC6AQ6EIG7 209 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF425Q6IV72 752 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GLRX5Q86SX6 157 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PAQR7Q86WK9 346 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM129CQ86XR2 697 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM20CQ8IXL6 584 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LSMEM2Q8N112 164 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRPV3Q8NET8 790 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR4K1Q8NGD4 311 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TWIST2Q8WVJ9 160 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa9.84□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SORT1Q99523 831 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms