RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 ATPIF1Q9UII2 106 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 KRBA1A5PL33 1030 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 PTTG1O95997 202 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 FSHRP23945 695 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 SCNN1AP37088 669 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 OCLNQ16625 522 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 RFT1Q96AA3 541 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 ARMC5Q96C12 935 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 ACBD6Q9BR61 282 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 TAS2R10Q9NYW0 307 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 MED31Q9Y3C7 131 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 SAP18O00422 153 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 HOXD13P35453 343 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 PQLC3Q8N755 202 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 SNX27Q96L92 541 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 HAS3O00219 553 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 GATBO75879 557 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 TFPIP10646 304 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 EPCAMP16422 314 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 HTR1EP28566 365 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 UAP1L1Q3KQV9 507 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 TMED4Q7Z7H5 227 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 Q8N402 240 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 PPTC7Q8NI37 304 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 HAPLN3Q96S86 360 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 TXLNGYQ9BZA5 131 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 C14orf105Q9NVL8 296 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 HCAR3P49019 387 aa18.08■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 PLA2G16P53816 162 aa18.08■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 SULT2A1Q06520 285 aa18.08■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP18.08■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa18.08■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 PM20D2Q8IYS1 436 aa18.08■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC32A1Q9H598 525 aa18.08■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 EXO5Q9H790 373 aa18.08■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 KIAA0513O60268 411 aa18.08■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 LRRN1Q6UXK5 716 aa18.08■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 LINC00471Q8N535 108 aa18.08■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 NFKBIDQ8NI38 313 aa18.08■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 KIAA1191Q96A73 305 aa18.08■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 S100PBPQ96BU1 408 aa18.08■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC29A3Q9BZD2 475 aa18.08■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM118AQ9NWS6 357 aa18.08■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 CACNA1FO60840 1977 aa18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 MON2Q7Z3U7 1717 aa18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 H3BMQ9 156 aa18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 CH25HO95992 272 aa18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 F8A1P23610 371 aa18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 OR1D2P34982 312 aa18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 GABARAPL2P60520 117 aa18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 NCS1P62166 190 aa18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 CYBRD1Q53TN4 286 aa18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 NAPRTQ6XQN6 538 aa18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 COG8Q96MW5 612 aa18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 VAMP1P23763 118 aa18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 OR12D2P58182 307 aa18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 SIRPB2Q5JXA9 342 aa18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 MOB2Q70IA6 237 aa18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ACOT12Q8WYK0 555 aa18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 BTBD1Q9H0C5 482 aa18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 PLEKHA1Q9HB21 404 aa18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 EDARQ9UNE0 448 aa18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ARVCFO00192 962 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 MANBAO00462 879 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 GRM6O15303 877 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 NARSO43776 548 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 TOXO94900 526 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 OPRL1P41146 370 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 GRK6P43250 576 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 CLCNKBP51801 687 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 RPP38P78345 283 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 VMACQ2NL98 169 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 OR13J1Q8NGT2 312 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 FBXO27Q8NI29 283 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 MGLLQ99685 303 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 B3GNT4Q9C0J1 378 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 TLE6Q9H808 572 aa18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms