RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572010.5

SLC12A4-208, Transcript of solute carrier family 12 member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC12A4, Length 1,016 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4-208ENST00000572010 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 A0A1W2PQ72 361 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 GOLGA8KD6RF30 607 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 GOLGA8TH3BQL2 631 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 RASAL1O95294 804 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 CATP04040 527 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 MGAT1P26572 445 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 TDGF1P3P51864 188 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 ART3Q13508 389 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 ABHD17BQ5VST6 288 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 CES3Q6UWW8 571 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 PAQR7Q86WK9 346 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 METTL21AQ8WXB1 218 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 LPGAT1Q92604 370 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 PHF12Q96QT6 1004 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 KIFC1Q9BW19 673 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 DRC3Q9H069 523 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF700Q9H0M5 742 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 TAC3Q9UHF0 121 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 TEKT2Q9UIF3 430 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 MKL2Q9ULH7 1088 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 ARHGEF33A8MVX0 844 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 I3L1I5 382 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 MYO1CO00159 1063 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 UNC5CO95185 931 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 WDPCPO95876 746 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 ERGP11308 486 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 PRF1P14222 555 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 EZRP15311 586 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 AVPR1BP47901 424 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 PNLIPRP1P54315 467 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 ADARP55265 1226 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 RPS6KA1Q15418 735 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 NDUFA9Q16795 377 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 KLHL38Q2WGJ6 581 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 ACSBG2Q5FVE4 666 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 ICE2Q659A1 982 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 ADCK2Q7Z695 626 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 MCEMP1Q8IX19 187 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 AMER3Q8N944 861 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 OR2A5Q96R48 311 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 PKP4Q99569 1192 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 TUBB6Q9BUF5 446 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 ABCF3Q9NUQ8 709 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 SEC14L3Q9UDX4 400 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 GUCA1BQ9UMX6 200 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 LRBAP50851 2863 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 CCL21O00585 134 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 CELA2AP08217 269 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 ITGAMP11215 1152 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 ABATP80404 500 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 RELAQ04206 551 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 RBPJQ06330 500 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 FAM53BQ14153 422 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 GBX1Q14549 363 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 LONRF1Q17RB8 773 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 TYSND1Q2T9J0 566 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 MTFR2Q6P444 385 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 TMEM139Q8IV31 216 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 RNF32Q9H0A6 362 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 SYBUQ9NX95 663 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 ABI3Q9P2A4 366 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 PCYOX1Q9UHG3 505 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SLC12A4-208ENST00000572010 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 OR5H15A6NDH6 313 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 FOXS1O43638 330 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 SYF2O95926 243 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 C8orf89P0DMQ9 161 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 PAMP19021 973 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 ARNTP27540 789 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 CASP6P55212 293 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 SARNPP82979 210 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 CDK16Q00536 496 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF33BQ06732 778 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 PCOLCEQ15113 449 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 TTLL9Q3SXZ7 439 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF425Q6IV72 752 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 TMEM205Q6UW68 189 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 MCOLN3Q8TDD5 553 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 GALPQ9UBC7 116 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 SOX13Q9UN79 622 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 A8MUI8 341 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 PRAMEF2O60811 474 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 SLC16A8O95907 504 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 OGNP20774 298 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms