RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 OR4L1Q8NH43 312 aa5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 FAM45AQ8TCE6 357 aa5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 NACC2Q96BF6 587 aa5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 RMDN1Q96DB5 314 aa5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 SGF29Q96ES7 293 aa5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 SIKE1Q9BRV8 207 aa5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 DRC3Q9H069 523 aa5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 BTBD1Q9H0C5 482 aa5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 LINC00597Q9H2U6 94 aa5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 ABCB8Q9NUT2 735 aa5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 ETAA1Q9NY74 926 aa5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 TAS2R1Q9NYW7 299 aa5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 PLK2Q9NYY3 685 aa5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 ARMCX1Q9P291 453 aa5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 GALPQ9UBC7 116 aa5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 XPR1Q9UBH6 696 aa5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 MID2Q9UJV3 735 aa5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 VPS28Q9UK41 221 aa5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 CCL26Q9Y258 94 aa5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 RAP2CQ9Y3L5 183 aa5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 NOX1Q9Y5S8 564 aa5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 PTPRDP23468 1912 aa5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 PLXNA3P51805 1871 aa5.34□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 PATJQ8NI35 1801 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 A0A087WWL8 130 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 NEMP2A6NFY4 417 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 C2orf81A6NN90 581 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 A8MT66 165 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 C5orf67F2Z3F1 127 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 H7C0S8 307 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 TOR1BO14657 336 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 PEX14O75381 377 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 RFPL2O75678 378 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ZFPL1O95159 310 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 PGLSO95336 258 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 PIGNO95427 931 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ATP6V1G2O95670 118 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 HSPA4LO95757 839 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 GLUD1P00367 558 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 PENKP01210 267 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 CHRNGP07510 517 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 RBP1P09455 135 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 CCDC166P0CW27 439 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 CD1EP15812 388 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 CD1DP15813 335 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 EPCAMP16422 314 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 PTPN2P17706 415 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 CALB2P22676 271 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 FMO4P31512 558 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 GKP32189 559 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 SLC12A2P55011 1212 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 RHOAP61586 193 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 RPS16P62249 146 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 BLOC1S1P78537 153 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 NTHL1P78549 312 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ARHGAP8P85298 464 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 SLC20A2Q08357 652 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 TCF15Q12870 199 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 RAB32Q13637 225 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 RCN2Q14257 317 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 TEAD2Q15562 447 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 CYP2A13Q16696 494 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 SLC5A9Q2M3M2 681 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 SLC44A4Q53GD3 710 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 UNC50Q53HI1 259 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 DGKKQ5KSL6 1271 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 PPM1LQ5SGD2 360 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 PLPP4Q5VZY2 271 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 MRNIPQ6NTE8 343 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 TPGS1Q6ZTW0 290 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 PIM3Q86V86 326 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 TMEM25Q86YD3 366 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 CAMK1DQ8IU85 385 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 PIANPQ8IYJ0 282 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 CMTM8Q8IZV2 173 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 KDM1BQ8NB78 822 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 POC1BQ8TC44 478 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 PPP4R1Q8TF05 950 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 DDI1Q8WTU0 396 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 LPGAT1Q92604 370 aa5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms