RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 BIRC2Q13490 618 aa22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 KIR2DS3Q14952 304 aa22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 PLD3Q8IV08 490 aa22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 FITM2Q8N6M3 262 aa22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 OR4K1Q8NGD4 311 aa22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 SELENOMQ8WWX9 145 aa22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 MARK4Q96L34 752 aa22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 SLC38A3Q99624 504 aa22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 DPH7Q9BTV6 452 aa22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 SNX6Q9UNH7 406 aa22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 ASXL3Q9C0F0 2248 aa22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 UBXN7O94888 489 aa22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 SYPP08247 313 aa22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 LSSP48449 732 aa22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 CCT8P50990 548 aa22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 CCR8P51685 355 aa22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 SPDYAQ5MJ70 313 aa22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 ACAD11Q709F0 780 aa22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 SUMF1Q8NBK3 374 aa22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 OR4C6Q8NH72 309 aa22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 ACTRT2Q8TDY3 377 aa22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 TUBGCP3Q96CW5 907 aa22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 EFCAB11Q9BUY7 163 aa22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 ACPTQ9BZG2 426 aa22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 UCK1Q9HA47 277 aa22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 EVA1BQ9NVM1 165 aa22.38■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 FAM221BA6H8Z2 402 aa22.37■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 OR5K3A6NET4 321 aa22.37■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 SIGLEC6O43699 453 aa22.37■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 PEX11AO75192 247 aa22.37■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 CER1O95813 267 aa22.37■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 MED27Q6P2C8 311 aa22.37■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 C6orf89Q6UWU4 347 aa22.37■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 TRIM46Q7Z4K8 759 aa22.37■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 MINDY1Q8N5J2 469 aa22.37■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 KLHL25Q9H0H3 589 aa22.37■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 PELI2Q9HAT8 420 aa22.37■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 PCNAP12004 261 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 ALDH4A1P30038 563 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 IFT88Q13099 833 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 ADCK2Q7Z695 626 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 LAS2Q8IYD9 372 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 ANKRD53Q8N9V6 530 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 AVL9Q8NBF6 648 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 CEP70Q8NHQ1 597 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 HUS1BQ8NHY5 278 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 CCT6BQ92526 530 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 CCDC28BQ9BUN5 200 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 SYNPO2LQ9H987 977 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 ARMCX1Q9P291 453 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 U3KQA8 63 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 LNP1A1A4G5 178 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 LILRA5A6NI73 299 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 RHPN2P1A8MT19 583 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 FCHO1O14526 889 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 PRAMEF10O60809 474 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 SH3BGRLO75368 114 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 GRIA3P42263 894 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 ABATP80404 500 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 NKAIN2Q5VXU1 208 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 LAIR1Q6GTX8 287 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 VN1R5Q7Z5H4 357 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 EID2Q8N6I1 236 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 SLC22A18Q96BI1 424 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 APOLD1Q96LR9 279 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 MAGEB17A8MXT2 336 aa22.35■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 PVRP15151 417 aa22.35■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 CMPK1P30085 196 aa22.35■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 OR1D5P58170 312 aa22.35■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 GALNTL6Q49A17 601 aa22.35■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 PAGE2BQ5JRK9 111 aa22.35■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 SPESP1Q6UW49 350 aa22.35■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 OOSP2Q86WS3 158 aa22.35■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 STON2Q8WXE9 905 aa22.35■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 LRRC37BQ96QE4 947 aa22.35■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 MYLK2Q9H1R3 596 aa22.35■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 PADI4Q9UM07 663 aa22.35■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 C2orf74A8MZ97 194 aa22.34■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 LSM1O15116 133 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 YKT6O15498 198 aa22.34■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 ETHE1O95571 254 aa22.34■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 PRR35P0CG20 571 aa22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms