RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 DOCK10Q96BY6 2186 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 E7ENX8 843 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 PEX12O00623 359 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 ZBTB14O43829 449 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 CEACAM4O75871 244 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 UMODP07911 640 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 EZRP15311 586 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 GABRB3P28472 473 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 IMPA1P29218 277 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 STX2P32856 288 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 CARSP49589 748 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 RGS4P49798 205 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 CDKN2DP55273 166 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 FOXL2P58012 376 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 TBPL1P62380 186 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 TAP2Q03519 686 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 MGAT5Q09328 741 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 SP140Q13342 867 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 SSPNQ14714 243 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 SLMAPQ14BN4 828 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 FAM214AQ32MH5 1076 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 WASHC2DQ5SRD0 308 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 COX15Q7KZN9 410 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 ADCK2Q7Z695 626 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 SLC26A11Q86WA9 606 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 PAQR7Q86WK9 346 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 ANKMY2Q8IV38 441 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 OR4N4Q8N0Y3 316 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 DTWD1Q8N5C7 304 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 TEX19Q8NA77 164 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 CLEC1AQ8NC01 280 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 FBXO36Q8NEA4 188 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 FBXO25Q8TCJ0 367 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 PTERQ96BW5 349 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 LINGO1Q96FE5 620 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 FMO2Q99518 471 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 PLCD4Q9BRC7 762 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC1Q9BTT6 524 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 SLC26A1Q9H2B4 701 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 PLAC1Q9HBJ0 212 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 MLXIPLQ9NP71 852 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 SAYSD1Q9NPB0 183 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 SLC22A11Q9NSA0 550 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 ABCF3Q9NUQ8 709 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 TAS2R13Q9NYV9 303 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 GRHL1Q9NZI5 618 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 CTSFQ9UBX1 484 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 HYKKA2RU49 373 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 A6NL46 340 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 H0YGG7 62 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 HAT1O14929 419 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 TP73O15350 636 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 MED26O95402 600 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 ONECUT2O95948 504 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 IGHEP01854 428 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 AHSGP02765 367 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 ALBP02768 609 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 C8GP07360 202 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 TUBBP07437 444 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 MAGEA4P43358 317 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 OR1D4P47884 311 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 ABATP80404 500 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 RAPSNQ13702 412 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 NKG7Q16617 165 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 MUM1Q2TAK8 710 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 HKDC1Q2TB90 917 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 DCAF10Q5QP82 559 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF425Q6IV72 752 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 PAQR3Q6TCH7 311 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 CYHR1Q6ZMK1 362 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 OVCH1Q7RTY7 1134 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC25Q86WR0 208 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 RELL1Q8IUW5 271 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM151BQ8IW70 566 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
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