RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315423.11

TNIP2-201, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNIP2, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP2-201ENST00000315423 GNGT2O14610 69 aa24.3■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 EPN2O95208 641 aa24.3■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 C1orf105O95561 183 aa24.3■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 B3GALT4O96024 378 aa24.3■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 RB1P06400 928 aa24.3■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 GPX2P18283 190 aa24.3■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 HLCSP50747 726 aa24.3■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 OR7A2PQ8NGA2 310 aa24.3■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 RSPRY1Q96DX4 576 aa24.3■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 NUS1Q96E22 293 aa24.3■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 WDR34Q96EX3 536 aa24.3■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 ABHD8Q96I13 439 aa24.3■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 SPATA9Q9BWV2 254 aa24.3■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 GULP1Q9UBP9 304 aa24.3■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 GMEB1Q9Y692 573 aa24.3■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 PCM1Q15154 2024 aa24.29■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 CLIC1O00299 241 aa24.29■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 NFATC1O95644 943 aa24.29■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 PDHA2P29803 388 aa24.29■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 DPTQ07507 201 aa24.29■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa24.29■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 OR7G3Q8NG95 312 aa24.29■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 NXPE3Q969Y0 559 aa24.29■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 MAGEB17A8MXT2 336 aa24.29■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 TRMUO75648 421 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 C9orf64Q5T6V5 341 aa24.29■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 CPZQ66K79 652 aa24.29■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 CES5AQ6NT32 575 aa24.29■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 FOXJ1Q92949 421 aa24.29■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 ARRDC3Q96B67 414 aa24.29■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 MUS81Q96NY9 551 aa24.29■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 BTNL2Q9UIR0 455 aa24.29■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 LRRC74AQ0VAA2 488 aa24.28■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 SLC14A1Q13336 389 aa24.28■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 HIPK1Q86Z02 1210 aa24.28■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 CHTF18Q8WVB6 975 aa24.28■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 CXorf40BQ96DE9 158 aa24.28■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 PPP1R16AQ96I34 528 aa24.28■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 PHF12Q96QT6 1004 aa24.28■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 TOR3AQ9H497 397 aa24.28■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa24.28■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 SIRT5Q9NXA8 310 aa24.28■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 UTS2RQ9UKP6 389 aa24.28■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 ALPK3Q96L96 1907 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 PRRT4C9JH25 899 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 CALRP27797 417 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 DCTP40126 519 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 RAE1P78406 368 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 VAC14Q08AM6 782 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 VMACQ2NL98 169 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 RFX4Q33E94 735 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 MED27Q6P2C8 311 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 THAP5Q7Z6K1 395 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 ZZZ3Q8IYH5 903 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 CPA6Q8N4T0 437 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 ZNF480Q8WV37 535 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 EHD1Q9H4M9 534 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 ITM2CQ9NQX7 267 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 ENGP17813 658 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 PPIBP23284 216 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 HPCAL1P37235 193 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 TBPL1P62380 186 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 GAB4Q2WGN9 574 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 GALNT18Q6P9A2 607 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 HUS1BQ8NHY5 278 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 NEIL2Q969S2 332 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 EFCAB11Q9BUY7 163 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 DUSP26Q9BV47 211 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 SGPP1Q9BX95 441 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 FAM118AQ9NWS6 357 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 DEC1Q9P2X7 70 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 RPS6KA6Q9UK32 745 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 CORO2BQ9UQ03 480 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP2-201ENST00000315423 PAPLNO95428 1278 aa24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms