RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489390.1

SHOC2-205, Transcript of SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein, human

TSL 5

Gene SHOC2, Length 815 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHOC2-205	ENST00000489390	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	RNF44	Q7L0R7	432 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	CD163	Q86VB7	1156 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	AMER3	Q8N944	861 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	RND1	Q92730	232 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	MBD6	Q96DN6	1003 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	ARSG	Q96EG1	525 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	CABS1	Q96KC9	395 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	C18orf12	Q96KH6	178 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	OLFM1	Q99784	485 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	SMR3A	Q99954	134 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	SERPING1	P05155	500 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	PRSS56	P0CW18	603 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	PTGS2	P35354	604 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	TFDP2	Q14188	446 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	ITIH4	Q14624	930 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	BTBD16	Q32M84	506 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	TMEM198	Q66K66	360 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	PACS1	Q6VY07	963 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	IL17F	Q96PD4	163 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	APOL2	Q9BQE5	337 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	GBA3	Q9H227	469 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	ANO10	Q9NW15	660 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	CDK2AP1	O14519	115 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	NEURL1	O76050	574 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	CYC1	P08574	325 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	ANXA5	P08758	320 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	PTGER1	P34995	402 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	EFNA3	P52797	238 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	DGKQ	P52824	942 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	MESD	Q14696	234 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	ODF2	Q5BJF6	829 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	FIGN	Q5HY92	759 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	LRRC38	Q5VT99	294 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	H2AFV	Q71UI9	128 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	NPAS2	Q99743	824 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	KCNK13	Q9HB14	408 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	COL6A5	A8TX70	2615 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390		A0A1B0GTH9	108 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	GABRR3	A8MPY1	467 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	NME2P1	O60361	137 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	NRP2	O60462	931 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	CST8	O60676	142 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	HEXA	P06865	529 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	INHBB	P09529	407 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	OR56A5	P0C7T3	313 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	NME2	P22392	152 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	OR2L3	Q8NG85	312 aa		13.41	□□□□□ -0.26

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