RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 LAG3P18627 525 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 CD6P30203 668 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 MAGEA2P43356 314 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2T5Q6IEZ7 315 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF783Q6ZMS7 281 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 VTCN1Q7Z7D3 282 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR26Q8NDV2 337 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 SETD9Q8NE22 299 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2T29Q8NH02 315 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 FBLIM1Q8WUP2 373 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF566Q969W8 418 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 TAMM41Q96BW9 452 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM106CQ9BVX2 250 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 GMPPBQ9Y5P6 360 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 GRXCR1A8MXD5 290 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 CCNDBP1O95273 360 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 IL1RNP18510 177 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 PSMB9P28065 219 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGDIAP52565 204 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 VEPH1Q14D04 833 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 CDKN3Q16667 212 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 C7orf61Q8IZ16 206 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ALG14Q96F25 216 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ALPK1Q96QP1 1244 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 EBPLQ9BY08 206 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM247A6NEH6 219 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 NADKO95544 446 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 FADS2O95864 444 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 PRPS2P11908 318 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 EPHA2P29317 976 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 HPCAL1P37235 193 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 GAREM2Q75VX8 874 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ZSWIM9Q86XI8 627 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDH12Q9NPG4 1184 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 KCTD5Q9NXV2 234 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 TPRKBQ9Y3C4 175 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 EVPLLA8MZ36 301 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 M0QX08 132 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAM23O75077 832 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 CXCL14O95715 111 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 UGT2B4P06133 528 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 CKMP06732 381 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 CCR7P32248 378 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC35A2P78381 396 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 HSPA14Q0VDF9 509 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 GBX1Q14549 363 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ACOX1Q15067 660 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM236Q5W0B7 351 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 TPGS1Q6ZTW0 290 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 DCAF4L2Q8NA75 395 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF540Q8NDQ6 660 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 CERS4Q9HA82 394 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 IL1RAPQ9NPH3 570 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 AKIP1Q9NQ31 210 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 SNX6Q9UNH7 406 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 BNIP3LO60238 219 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 MT-ND2P03891 347 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 MASP1P48740 699 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 CD300CQ08708 224 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 TCF25Q9BQ70 676 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 CORO1BQ9BR76 489 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 RASSF1Q9NS23 344 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 SCN3BQ9NY72 215 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 SCN8AQ9UQD0 1980 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 KRBA1A5PL33 1030 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA0355O15063 1070 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00271P0C7V0 271 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 VLDLRP98155 873 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB33AQ14088 237 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 PAGE2BQ5JRK9 111 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 P2RY8Q86VZ1 359 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 CDC26Q8NHZ8 85 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 UBE2FQ969M7 185 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ERLEC1Q96DZ1 483 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 PANX1Q96RD7 426 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 DUSP21Q9H596 190 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 INIPQ9NRY2 104 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIOO75962 3097 aa18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms