RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 PROX1Q92786 737 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 GLMNQ92990 594 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SUV39H2Q9H5I1 410 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SACM1LQ9NTJ5 587 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 F5P12259 2224 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PCDH7O60245 1069 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 LEFTY1O75610 366 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SLC16A8O95907 504 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 IGSF6O95976 241 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 URODP06132 367 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ISL1P61371 349 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 GAB1Q13480 694 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 GANABQ14697 944 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 BROXQ5VW32 411 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CLIP4Q8N3C7 705 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PACRGLQ8N7B6 248 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 HSH2DQ96JZ2 352 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ZSWIM3Q96MP5 696 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 OR4K3Q96R72 315 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 OR51B5Q9H339 312 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 DNAJB9Q9UBS3 223 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 TMEM247A6NEH6 219 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ARHGEF33A8MVX0 844 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ANGPTL1O95841 491 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 HIST1H2ADP20671 130 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 DCKP27707 260 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CRYBA2P53672 197 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CREMQ03060 361 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CDK5R2Q13319 367 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ADRM1Q16186 407 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PAGE2BQ5JRK9 111 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PRSS36Q5K4E3 855 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 NAGSQ8N159 534 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SPPL2AQ8TCT8 520 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PXYLP1Q8TE99 480 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 HIST1H2AJQ99878 128 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 H2AFJQ9BTM1 129 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 UGT2B28Q9BY64 529 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SPNS1Q9H2V7 528 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SLC32A1Q9H598 525 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 RERGLQ9H628 205 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ZNF639Q9UID6 485 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 NOTCH4Q99466 2003 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ARNTLO00327 626 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 RTCAO00442 366 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 LATO43561 262 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 NOL3O60936 208 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 KRT6AP02538 564 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 MT-ND2P03891 347 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 SOD2P04179 222 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 KRT6BP04259 564 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 ETFAP13804 333 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 CD6P30203 668 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 KIR3DL1P43629 444 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 KRT6CP48668 564 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 IDH2P48735 452 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 NUP107P57740 925 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 PFN3P60673 137 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 IFITM3Q01628 133 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 DOC2AQ14183 400 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 ADPRMQ3LIE5 342 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 TCEAL5Q5H9L2 206 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 COQ5Q5HYK3 327 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 C22orf39Q6P5X5 142 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 TMPRSS11BQ86T26 416 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 IGFN1Q86VF2 1251 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 EID3Q8N140 333 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 CENPSQ8N2Z9 138 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 NODALQ96S42 347 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 MACROD1Q9BQ69 325 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 RIMKLBQ9ULI2 386 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 KPNA5O15131 536 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 C8AP07357 584 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 CTSLP07711 333 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 EBLN1P0CF75 366 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 UMPSP11172 480 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 NSG1P42857 185 aa8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms