RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624145.3

ANKRD28-215, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,383 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-215ENST00000624145 B4DGG1 531 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 PIP5K1BO14986 540 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 PI15O43692 258 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SFTPBP07988 381 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CYP3A4P08684 503 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 TNFRSF8P28908 595 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CD52P31358 61 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF84P51523 738 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CCR8P51685 355 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CTBP2P56545 445 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 TAS2R43P59537 309 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 FSTL1Q12841 308 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 IRF5Q13568 498 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CCINQ13939 588 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 GANABQ14697 944 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 HERC3Q15034 1050 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 GPR68Q15743 365 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 HSD17B12Q53GQ0 312 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ZYG11AQ6WRX3 759 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CMC1Q7Z7K0 106 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF280BQ86YH2 543 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SNX29P2Q8IUI4 249 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CBR4Q8N4T8 237 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 LINC00471Q8N535 108 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CREB3L1Q96BA8 519 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 MALSU1Q96EH3 234 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 AGAP2Q99490 1192 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 MECRQ9BV79 373 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 Q9N2J8 555 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF358Q9NW07 568 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 GPRC5BQ9NZH0 403 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SNX10Q9Y5X0 201 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 NEO1Q92859 1461 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ISPDA4D126 451 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ANKRD63C9JTQ0 380 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 MEN1O00255 615 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC22A1O15245 554 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC31A1O15431 190 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 NTSR2O95665 410 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 TNFP01375 233 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CD3GP09693 182 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 HTR2AP28223 471 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 HTR7P34969 479 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CRHR1P34998 444 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ACTR1BP42025 376 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 HSD11B2P80365 405 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CDK3Q00526 305 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CD83Q01151 205 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC3A1Q07837 685 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 LRRC32Q14392 662 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 NFE2L1Q14494 772 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 BBS12Q6ZW61 710 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ANKRD46Q86W74 232 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF283Q8N7M2 679 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CAMKVQ8NCB2 501 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 OR10G2Q8NGC3 310 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 OR51D1Q8NGF3 324 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 OR52E4Q8NGH9 312 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 OR10A6Q8NH74 314 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ART4Q93070 314 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ARMC5Q96C12 935 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 RBP7Q96R05 134 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 DUSP26Q9BV47 211 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 PBDC1Q9BVG4 233 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 TMED9Q9BVK6 235 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CXorf21Q9HAI6 301 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 TAS2R10Q9NYW0 307 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 PLK2Q9NYY3 685 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 MAB21L2Q9Y586 359 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC15A5A6NIM6 579 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 A6NLC8 198 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 J3QLW9 94 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 MT-ND5P03915 603 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SHBGP04278 402 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 NUDT17P0C025 328 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF19P17023 458 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 RPL10P27635 214 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 PRDX6P30041 224 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 MAGEA8P43361 318 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SMSP52788 366 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 RPS14P62263 151 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms