RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490813.5

CEP170-216, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CEP170, Length 1,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-216	ENST00000490813	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	MLKL	Q8NB16	471 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	PSMF1	Q92530	271 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	PPM1M	Q96MI6	270 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	SMIM14	Q96QK8	99 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	CUTC	Q9NTM9	273 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	EURL	Q9NYK6	297 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	DTL	Q9NZJ0	730 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	C3orf18	Q9UK00	162 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	PKP3	Q9Y446	797 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	ALG6	Q9Y672	507 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	DNAJC13	O75165	2243 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	FAM170A	A1A519	330 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	QSOX1	O00391	747 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	BIN1	O00499	593 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	CES2	O00748	559 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	ALOX12B	O75342	701 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	TOX	O94900	526 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	SLCO2B1	O94956	709 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	NDST3	O95803	873 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	IFNA2	P01563	188 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	EPO	P01588	193 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	UGT2B7	P16662	529 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	HOXC12	P31275	282 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	PTGS2	P35354	604 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	EMP2	P54851	167 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	JAM2	P57087	298 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF33B	Q06732	778 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	TFF3	Q07654	80 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	KLC1	Q07866	573 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	MAMLD1	Q13495	774 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	OLIG2	Q13516	323 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	KRT81	Q14533	505 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	NAA25	Q14CX7	972 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	MEP1A	Q16819	746 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	KDELC1	Q6UW63	502 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	CCNY	Q8ND76	341 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	HDAC10	Q969S8	669 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	ULK4	Q96C45	1275 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	EID2B	Q96D98	161 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	MVB12A	Q96EY5	273 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	PEBP4	Q96S96	227 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	OLFM1	Q99784	485 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	AGPAT1	Q99943	283 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	BDH2	Q9BUT1	245 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	FAM60A	Q9NP50	221 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	IL26	Q9NPH9	171 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	RASSF1	Q9NS23	344 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP170-216	ENST00000490813	RNF6	Q9Y252	685 aa		5.36	□□□□□ -1.55

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