RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 DNTTP04053 509 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ICAM1P05362 532 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 URODP06132 367 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 VPREB1P12018 145 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 CDH3P22223 829 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 FASP25445 335 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 RPL9P32969 192 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 SPRP35270 261 aaPredicted RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 CETN2P41208 172 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 PTGDSP41222 190 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 PAFAH1B1P43034 410 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC26A2P50443 739 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ALDH3A2P51648 485 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARSEP51690 589 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 RARSP54136 660 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF45Q02386 682 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 FOXO1Q12778 655 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 GCKRQ14397 625 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 KRT33BQ14525 404 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCNG2Q16589 344 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ODF4Q2M2E3 257 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 CNPY1Q3B7I2 92 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 DPCR1Q3MIW9 517 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC22A6Q4U2R8 563 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 VWA2Q5GFL6 755 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC35D3Q5M8T2 416 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ELFN2Q5R3F8 820 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 MACC1Q6ZN28 852 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 Q6ZS52 159 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 NUDT13Q86X67 352 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 TEX11Q8IYF3 940 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 NDUFAF2Q8N183 169 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 CADM2Q8N3J6 435 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM89BQ8N5H3 189 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF491Q8N8L2 437 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 LINC01555Q8NAE3 123 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR52N5Q8NH56 324 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCDC26Q8TAB7 109 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 TTC8Q8TAM2 541 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 GSDMBQ8TAX9 411 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ANKRD49Q8WVL7 239 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 POMGNT1Q8WZA1 660 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 RMDN3Q96TC7 470 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 LPAR4Q99677 370 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 C16orf70Q9BSU1 422 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 PAXXQ9BUH6 204 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ABHD6Q9BV23 337 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRIM7Q9C029 511 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR2B2Q9GZK3 357 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 PDCL3Q9H2J4 239 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 NANOGQ9H9S0 305 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRPV4Q9HBA0 871 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 EPB41L5Q9HCM4 733 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 HHATLQ9HCP6 504 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 AMACRQ9UHK6 382 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 NME7Q9Y5B8 376 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 TNRQ92752 1358 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGSF1Q8N6C5 1336 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP0.25□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 NKX6-3A6NJ46 265 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 C2orf81A6NN90 581 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARHGEF33A8MVX0 844 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 NPIPB9F8W1W9 429 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ATP2A1O14983 1001 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 INPP4BO15327 924 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 TEX28O15482 410 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 KLK10O43240 276 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLPP2O43688 288 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ICOSLGO75144 302 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 CAND2O75155 1236 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 RHBDL1O75783 438 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 GH2P01242 217 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 KRT18P05783 430 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 MYL6BP14649 208 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 GJA1P17302 382 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 HTR1FP30939 366 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ABCD1P33897 745 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 PPM1AP35813 382 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 CPOXP36551 454 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 MNDAP41218 407 aa0.25□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms