RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328596.10

TNFRSF18-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 18, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF18, Length 851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18-201ENST00000328596 PAQR3Q6TCH7 311 aa20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 ZDHHC24Q6UX98 284 aa20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 ZBED8Q8IZ13 594 aa20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 ZNF480Q8WV37 535 aa20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 DLG3Q92796 817 aa20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 GBP5Q96PP8 586 aa20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 C17orf62Q9BQA9 187 aa20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 SELENOSQ9BQE4 189 aa20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 FAM129AQ9BZQ8 928 aa20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 SLC25A18Q9H1K4 315 aa20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 MOCS1Q9NZB8 636 aa20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 ZFATQ9P243 1243 aa20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 TCFL5Q9UL49 500 aa20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 SNX7Q9UNH6 387 aa20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 PCM1Q15154 2024 aa20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 B8ZZF3 427 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 E7ENX8 843 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 CTSVO60911 334 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 GCGRP47871 477 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 ARSFP54793 590 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 DCDP81605 110 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 TAP2Q03519 686 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 MGAT5Q09328 741 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 NFATC3Q12968 1075 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 HECTD2Q5U5R9 776 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 ZNF605Q86T29 641 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 GPATCH11Q8N954 259 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 PPFIBP2Q8ND30 876 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 THAP4Q8WY91 577 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 ZNF285Q96NJ3 590 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 DPH7Q9BTV6 452 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 DHRS4Q9BTZ2 278 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 ENAMQ9NRM1 1142 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 ANKMY1Q9P2S6 941 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 VWA7Q9Y334 891 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF18-201ENST00000328596 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 OR2A25A4D2G3 310 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 C8GP07360 202 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 YBX1P67809 324 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 NFKB2Q00653 900 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 GRM7Q14831 915 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 FAM45BPQ6NSW5 357 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 RNF44Q7L0R7 432 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 PALM2Q8IXS6 379 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 MYO1HQ8N1T3 1032 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 FAM45AQ8TCE6 357 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 MCOLN3Q8TDD5 553 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 PYROXD1Q8WU10 500 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 SLC6A20Q9NP91 592 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 SAYSD1Q9NPB0 183 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 TAC3Q9UHF0 121 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 PADI2Q9Y2J8 665 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 SPTA1P02549 2419 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 FER1L5A0AVI2 2057 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 A0A0J9YVX5 310 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 SLC16A5O15375 505 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 NRP2O60462 931 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 CCNDBP1O95273 360 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 ALAS2P22557 587 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 FDXRP22570 491 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 IMPA1P29218 277 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 IL2P60568 153 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 SP140Q13342 867 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 MLIPQ5VWP3 458 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 ICE2Q659A1 982 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 LINGO1Q96FE5 620 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 PLCD4Q9BRC7 762 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 PARVBQ9HBI1 364 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 PDE10AQ9Y233 779 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 PSAT1Q9Y617 370 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 ZNF462Q96JM2 2506 aa20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 A0A1B0GX78 115 aa20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 FITM1A5D6W6 292 aa20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 TSPAN12O95859 305 aa20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 CD63P08962 238 aa20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 PMS2P54278 862 aa20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 WASHC2DQ5SRD0 308 aa20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 FAM69BQ5VUD6 431 aa20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 FRMPD2BQ6IN97 320 aa20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 FBXO42Q6P3S6 717 aa20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 TTLL10Q6ZVT0 673 aa20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF18-201ENST00000328596 STRA8Q7Z7C7 330 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms