RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	LAMA5	O15230	3695 aa		10.91	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	MYO1C	O00159	1063 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC16A5	O15375	505 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	RFPL1	O75677	317 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	TIAF1	O95411	115 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM87A	P0C7U9	286 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	MCM3	P25205	808 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	FOLR3	P41439	243 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	MGAT5	Q09328	741 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	NFATC3	Q12968	1075 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	GPS2	Q13227	327 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP2A13	Q16696	494 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	UGT8	Q16880	541 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	OR2L3	Q8NG85	312 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	ATL1	Q8WXF7	558 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF592	Q92610	1267 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF31	Q96EP0	1072 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC138	Q96M89	665 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	DPH5	Q9H2P9	285 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	VWA7	Q9Y334	891 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1B0GX78	115 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246		B8ZZF3	427 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	GSTA2	P09210	222 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	SAT1	P21673	171 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	C2orf54	Q08AI8	447 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	GBX1	Q14549	363 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	NCF4	Q15080	339 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	NDUFA9	Q16795	377 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	C8orf74	Q6P047	294 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	CD200R1	Q8TD46	325 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	ASB11	Q8WXH4	323 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	LINGO1	Q96FE5	620 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	PKP4	Q99569	1192 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	NDN	Q99608	321 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	DPH7	Q9BTV6	452 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	PARVB	Q9HBI1	364 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM60A	Q9NP50	221 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	TAC3	Q9UHF0	121 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A0J9YVX5	310 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC28A2	O43868	658 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	BANF1	O75531	89 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	AHSG	P02765	367 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	PRB1	P04280	392 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	ANXA5	P08758	320 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	TPBGL	P0DKB5	382 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	IVD	P26440	423 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	RORA	P35398	523 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	GRIA3	P42263	894 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	AP1S2	P56377	157 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	SKP1	P63208	163 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	OCA2	Q04671	838 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	GRB7	Q14451	532 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	SSPN	Q14714	243 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	MUM1	Q2TAK8	710 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		10.88	□□□□□ -0.67

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