RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1B0GX78 115 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 ARHGEF33A8MVX0 844 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 MASP2O00187 686 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 DSCR3O14972 297 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 CD63P08962 238 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 ATXN8OSP0DMR3 200 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 PKMP14618 531 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 ARSFP54793 590 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 SARNPP82979 210 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 DCAF10Q5QP82 559 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 FRMPD2BQ6IN97 320 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF549Q6P9A3 640 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 TTC23LQ6PF05 361 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 DLG3Q92796 817 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 FKBP10Q96AY3 582 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 PTERQ96BW5 349 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 IP6K3Q96PC2 410 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 SYNPO2LQ9H987 977 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 IRAK4Q9NWZ3 460 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 GPR83Q9NYM4 423 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 MRFAP1Q9Y605 127 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 SDR42E2A6NKP2 422 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 MYO1CO00159 1063 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF470Q6ECI4 717 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 RNF44Q7L0R7 432 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 OVCH1Q7RTY7 1134 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 DENND6AQ8IWF6 608 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 NAT8LQ8N9F0 302 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 SIGLEC10Q96LC7 697 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 SPSB2Q99619 263 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 SELENOSQ9BQE4 189 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 SLC26A1Q9H2B4 701 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 CUTCQ9NTM9 273 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 P4HTMQ9NXG6 502 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 NAV2Q8IVL1 2488 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 OR2A25A4D2G3 310 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 GOLGA8MH3BSY2 632 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 PAMP19021 973 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 CHRM3P20309 590 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 ALAS2P22557 587 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 KLHL38Q2WGJ6 581 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 TCTE1Q5JU00 501 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 CASC4Q6P4E1 433 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 OR9A1PQ8NGU1 263 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 FOPNLQ96NB1 174 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 SLC6A20Q9NP91 592 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 MAGEB16A2A368 324 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 TTLL8A6PVC2 850 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 UQCRFS1P47985 274 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 SOX8P57073 446 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 CTBP1Q13363 440 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 RAPSNQ13702 412 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 GRM7Q14831 915 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 NKG7Q16617 165 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 SLC6A19Q695T7 634 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 HPS6Q86YV9 775 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 OR4N4Q8N0Y3 316 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 CPT1CQ8TCG5 803 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 MAGEC3Q8TD91 643 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 ACTRT1Q8TDG2 376 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 WDR54Q9H977 334 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 PFDN6O15212 129 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 KIF5CO60282 957 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 DPM1O60762 260 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 ALBP02768 609 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 WASHC2DQ5SRD0 308 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 SLC35F6Q8N357 371 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 OSBPL9Q96SU4 736 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 SAMD15Q9P1V8 674 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 ANKMY1Q9P2S6 941 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 CTSFQ9UBX1 484 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 PHF2O75151 1096 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 USP1O94782 785 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 SLC1A2P43004 574 aa26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms