RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488297.2

RPS3AP22-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 22, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP22, Length 769 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP22-201ENST00000488297 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 NECTIN4Q96NY8 510 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 TRPV4Q9HBA0 871 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 GDE1Q9NZC3 331 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 MAN1B1Q9UKM7 699 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 GPR34Q9UPC5 381 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 TMEM5Q9Y2B1 443 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 TMED3Q9Y3Q3 217 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 ZHX2Q9Y6X8 837 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 MPTX1A8MV57 137 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 A8MV72 311 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 IDH3BO43837 385 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 IGHV2-70P01814 119 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 PRKACGP22612 351 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 LHCGRP22888 699 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 MPZP25189 248 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 MTHFRP42898 656 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 CSRP3P50461 194 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 MS4A2Q01362 244 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 CALCOCO2Q13137 446 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 UGT3A1Q6NUS8 523 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 ZNF343Q6P1L6 599 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 LMNTD2Q8IXW0 634 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 THAP8Q8NA92 274 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 CFAP61Q8NHU2 1237 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 NXNL1Q96CM4 212 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 TMCO6Q96DC7 493 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 SEPHS2Q99611 448 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 PDE7BQ9NP56 450 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 THEGQ9P2T0 379 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 PCDHGB4Q9UN71 923 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 NEMP2A6NFY4 417 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 ARPC2O15144 300 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 C22orf31O95567 290 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 PFKFB1P16118 471 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 CCR10P46092 362 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 ZNF75DP51815 510 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 LBX1P52954 281 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 EIF5P55010 431 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 CSNK2BP67870 215 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 STK4Q13043 487 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 RIGQ13278 110 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 ZNF74Q16587 644 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 MOGAT2Q3SYC2 334 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 HYIQ5T013 277 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 MFSD12Q6NUT3 480 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 NUP54Q7Z3B4 507 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 SH2D6Q7Z4S9 175 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 CATSPERDQ86XM0 798 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 CDC20BQ86Y33 519 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 DNAAF5Q86Y56 855 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 ERC1Q8IUD2 1116 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 PIGBQ92521 554 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 PTERQ96BW5 349 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 FOXN4Q96NZ1 517 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 PANK2Q9BZ23 570 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 MED20Q9H944 212 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 O00370 1275 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 LINGO3P0C6S8 592 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 HLA-FP30511 346 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 PTGER4P35408 488 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 ALDH3A2P51648 485 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 MAPK12P53778 367 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 TMEM50BP56557 158 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 UBXN2AP68543 259 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 KLC1Q07866 573 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 PRR27Q6MZM9 219 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 ZNF774Q6NX45 483 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 FAM198BQ6UWH4 519 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 KIF6Q6ZMV9 814 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 ADGRA1Q86SQ6 560 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 Q8N377 158 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 Q8NBF4 154 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 NUP37Q8NFH4 326 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 ATL1Q8WXF7 558 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 ARSGQ96EG1 525 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 C4orf45Q96LM5 186 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP22-201ENST00000488297 MTMR12Q9C0I1 747 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms