RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 CGREF1Q99674 301 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 YIPF4Q9BSR8 244 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 DUXAA6NLW8 204 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 LEFTY1O75610 366 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 STC2O76061 302 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 AVPR1BP47901 424 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 RAB8AP61006 207 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 SEMA3AQ14563 771 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 EOGTQ5NDL2 527 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 SLC8B1Q6J4K2 584 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 MZT2BQ6NZ67 158 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 OR4E2Q8NGC2 313 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 PIGXQ8TBF5 258 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 MYH7BA7E2Y1 1941 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 GIMD1P0DJR0 217 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 CYBAP13498 195 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 CCR10P46092 362 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
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HDLBP-241ENST00000487169 TCEAL1Q15170 157 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 MCEMP1Q8IX19 187 aa13.04□□□□□ -0.32
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HDLBP-241ENST00000487169 OR51B5Q9H339 312 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 MOCS1Q9NZB8 636 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 TJP1Q07157 1748 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 C2orf78A6NCI8 922 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 RIIAD1A6NNX1 92 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 SLC22A2O15244 555 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 TNFRSF21O75509 655 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 OAS1P00973 400 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 BDKRB1P46663 353 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 LMAN2Q12907 356 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 PIK3R6Q5UE93 754 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 SUSD1Q6UWL2 747 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 DNAJB8Q8NHS0 232 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 SHDQ96IW2 340 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 PLGRKTQ9HBL7 147 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 PDLIM7Q9NR12 457 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 DCLK1O15075 740 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 KMOO15229 486 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 OAZ2O95190 189 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 STATHP02808 62 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 RGS21Q2M5E4 152 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 CANT1Q8WVQ1 401 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 LRRC58Q96CX6 371 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 FCRL4Q96PJ5 515 aa13.03□□□□□ -0.32
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HDLBP-241ENST00000487169 HAPLN2Q9GZV7 340 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 SNX7Q9UNH6 387 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 CCNB2O95067 398 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 PGLSO95336 258 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 RAP2AP10114 183 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 GPR153Q6NV75 609 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 PRR23BQ6ZRT6 265 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 ARMCX6Q7L4S7 300 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 GALNT15Q8N3T1 639 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 HM13Q8TCT9 377 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 CMTM7Q96FZ5 175 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 GORASP1Q9BQQ3 440 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 GSDMCQ9BYG8 508 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 AMBNQ9NP70 447 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 SPATA7Q9P0W8 599 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 ERVK-11Q9UQG0 969 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 IRGMA1A4Y4 181 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 FAM92AA1XBS5 289 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 KLF11O14901 512 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 NDUFS4O43181 175 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 CBSLP0DN79 551 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 CBSP35520 551 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 OMPP47874 163 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 SMARCD3Q6STE5 483 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 JAZF1Q86VZ6 243 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 CAMKVQ8NCB2 501 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 OR5AK3PQ8NH89 298 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 AP3S1Q92572 193 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 TP53INP1Q96A56 240 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 OR51V1Q9H2C8 321 aa13.03□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 ALKBH4Q9NXW9 302 aa13.03□□□□□ -0.32
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