RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399469.2

HIVEP1-202, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene HIVEP1, Length 2,085 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1-202ENST00000399469 AGTRAPQ6RW13 159 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 LPCAT2Q7L5N7 544 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 RD3Q7Z3Z2 195 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 HID1Q8IV36 788 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 C1orf210Q8IVY1 113 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 OR9A1PQ8NGU1 263 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 RFWD2Q8NHY2 731 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 AGR3Q8TD06 166 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 AGAP11Q8TF27 550 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 DNASE2BQ8WZ79 361 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 C12orf66Q96MD2 445 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 GSDMCQ9BYG8 508 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 SLC32A1Q9H598 525 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 IPPKQ9H8X2 491 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 ACSS2Q9NR19 701 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 RASSF1Q9NS23 344 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 DNAJC11Q9NVH1 559 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 PNPOQ9NVS9 261 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 PSMD13Q9UNM6 376 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 INVSQ9Y283 1065 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 HGSO14964 777 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 AZIN1O14977 448 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 WDR47O94967 919 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 SLC16A8O95907 504 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 PAHP00439 452 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 FGF4P08620 206 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 TDGF1P13385 188 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 SLC2A4P14672 509 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 BCKDHBP21953 392 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 ACTR1BP42025 376 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 CCR10P46092 362 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 MAN2A2P49641 1150 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 CCNG1P51959 295 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 ACTR1AP61163 376 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 SH3BP2P78314 561 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 CTBSQ01459 385 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 CDC16Q13042 620 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 FZD2Q14332 565 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 PTCHD3Q3KNS1 767 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 FBXO48Q5FWF7 155 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 THNSL2Q86YJ6 484 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 PEX5LQ8IYB4 626 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 SYTL1Q8IYJ3 562 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 CLYBLQ8N0X4 340 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 DEFB119Q8N690 84 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 MOCOSQ96EN8 888 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 PKP4Q99569 1192 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 CCT7Q99832 543 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 TMEM168Q9H0V1 697 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 MVB12BQ9H7P6 319 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 ZBTB26Q9HCK0 441 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 TM9SF3Q9HD45 589 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 LAMP5Q9UJQ1 280 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 FBXO4Q9UKT5 387 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 TRAF6Q9Y4K3 522 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa7.24□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 VCANP13611 3396 aa7.23□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa7.23□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 A0A1W2PR77 199 aa7.23□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa7.23□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 ENO1P06733 434 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 UROSP10746 265 aa7.23□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 F3P13726 295 aa7.23□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 CTSEP14091 401 aa7.23□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 IMPA1P29218 277 aa7.23□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 SOX11P35716 441 aa7.23□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 GDF5P43026 501 aa7.23□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 FNTBP49356 437 aa7.23□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 DMWDQ09019 674 aa7.23□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 KRT33BQ14525 404 aa7.23□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 TEAD4Q15561 434 aa7.23□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 KANK2Q63ZY3 851 aa7.23□□□□□ -1.25
HIVEP1-202ENST00000399469 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms