RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338045.7

LIMS1-202, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-202ENST00000338045 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 EFCAB1Q9HAE3 211 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 SPATA7Q9P0W8 599 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 MOSPD1Q9UJG1 213 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 AIM2O14862 343 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 PI15O43692 258 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 CCND1P24385 295 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 NUDT2P50583 147 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 CTBSQ01459 385 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 HMGCS1Q01581 520 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 RPS6KA2Q15349 733 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 CYP2A13Q16696 494 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 DSELQ8IZU8 1212 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 WDR20Q8TBZ3 569 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 TSPEARQ8WU66 669 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 NEIL2Q969S2 332 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 BIRC7Q96CA5 298 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 C12orf66Q96MD2 445 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 THTPAQ9BU02 230 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 CHRDQ9H2X0 955 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 EHD1Q9H4M9 534 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 ASIC5Q9NY37 505 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 ZIM2Q9NZV7 527 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 A0A088AWK7 358 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 A8MUI8 341 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 FBP2O00757 339 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 CLCA4Q14CN2 919 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 KIAA0040Q15053 153 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 UAP1L1Q3KQV9 507 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 SGO1Q5FBB7 561 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 ZFAND4Q86XD8 727 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 ULK2Q8IYT8 1036 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 CLDN23Q96B33 292 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 C1orf50Q9BV19 199 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 GPR174Q9BXC1 333 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 SLC52A3Q9NQ40 469 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 NDE1Q9NXR1 346 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 RABIFP47224 123 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 PRKG2Q13237 762 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 LRP8Q14114 963 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 IMPG1Q17R60 797 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 PGM2L1Q6PCE3 622 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 LCTLQ6UWM7 567 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 C16orf89Q6UX73 402 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 WASH2PQ6VEQ5 465 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 Q6ZSR6 202 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 SCUBE1Q8IWY4 988 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 UBALD2Q8IYN6 164 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 DEFB107AQ8IZN7 70 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 PGAM4Q8N0Y7 254 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 IL17FQ96PD4 163 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 ORAI3Q9BRQ5 295 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 LRTM1Q9HBL6 345 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 WASH6PQ9NQA3 447 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 GPR27Q9NS67 375 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 C1orf109Q9NX04 203 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 PLAGL1Q9UM63 463 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF839A8K0R7 811 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 BBIP1A8MTZ0 92 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ANKRD28O15084 1053 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 NRP2O60462 931 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SLC2A4P14672 509 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 NEK2P51955 445 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 THOP1P52888 689 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 RCAN2Q14206 197 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 IL23RQ5VWK5 629 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ATG9BQ674R7 924 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 REP15Q6BDI9 236 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SUSD1Q6UWL2 747 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TMPRSS11BQ86T26 416 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 GJD3Q8N144 294 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SPEM1Q8N4L4 309 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TEX37Q96LM6 180 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 NPAS2Q99743 824 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ACTL8Q9H568 366 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 MVB12BQ9H7P6 319 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TBC1D17Q9HA65 648 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms