RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295797.4

PRKCI-201, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCI, Length 4,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-201ENST00000295797 LINGO2Q7L985 606 aa18.25■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 HS3ST4Q9Y661 456 aa18.25■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 SCGNO76038 276 aa18.25■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 GCAP28676 217 aa18.25■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 ACVRL1P37023 503 aa18.25■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 KBTBD6Q86V97 674 aa18.25■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 CEP97Q8IW35 865 aa18.25■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC28AQ8IWP9 274 aa18.25■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 TMEM203Q969S6 136 aa18.25■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF696Q9H7X3 374 aa18.25■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 GDF5P43026 501 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 MAGEA2P43356 314 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 TP53INP2Q8IXH6 220 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 SLC37A3Q8NCC5 494 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 ZUFSPQ96AP4 578 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 NENFQ9UMX5 172 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 TPST2O60704 377 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 ELFN1P0C7U0 828 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 GSTT2BP0CG30 244 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 GNG2P59768 71 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 NFKB2Q00653 900 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 PIGFQ07326 219 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 MPPE1Q53F39 396 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 MED27Q6P2C8 311 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 SPACA7Q96KW9 195 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 DUSP26Q9BV47 211 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 EBF1Q9UH73 591 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 RNF6Q9Y252 685 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 PITPNM1O00562 1244 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 PER2O15055 1255 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 GABRR2P28476 465 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 CREB5Q02930 508 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 SCRN3Q0VDG4 424 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 OR4F6Q8NGB9 312 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 EDIL3O43854 480 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 CDK14O94921 469 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 CCL23P55773 120 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 DNAJB13P59910 316 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 NIPAL4Q0D2K0 466 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 GRB7Q14451 532 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 TSTQ16762 297 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 CYP2U1Q7Z449 544 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 CHST4Q8NCG5 386 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 TRIM2Q9C040 744 aa18.24■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 MCIDASD6RGH6 385 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 MS4A2Q01362 244 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 GANABQ14697 944 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF311Q5JNZ3 666 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 CXorf40BQ96DE9 158 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 TLR6Q9Y2C9 796 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 OPN1SWP03999 348 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 DNAJB1P25685 340 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 TMEM44Q2T9K0 475 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 OR4F3Q6IEY1 312 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 CEP76Q8TAP6 659 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 TTLL2Q9BWV7 592 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 OR51V1Q9H2C8 321 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 NECTIN3Q9NQS3 549 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 CFAP97Q9P2B7 532 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 CLIC1O00299 241 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 MAGEB3O15480 346 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 SPANXN4Q5MJ08 99 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 OR52E8Q6IFG1 317 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 TMEM135Q86UB9 458 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 RNF31Q96EP0 1072 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 DPP7Q9UHL4 492 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF487B1APH4 448 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 IL1BP01584 269 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 NANOGP8Q6NSW7 305 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 PRR23CQ6ZRP0 262 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 SLC9A6Q92581 669 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 TUBA1CQ9BQE3 449 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 MMP27Q9H306 513 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 NANOGQ9H9S0 305 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 FKBP14Q9NWM8 211 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 RIMKLBQ9ULI2 386 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 C5P01031 1676 aa18.23■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 ADAM8P78325 824 aa18.22■□□□□ 0.51
PRKCI-201ENST00000295797 TCEAL5Q5H9L2 206 aa18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms