RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266546.10

CLSTN3-201, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSTN3, Length 4,185 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-201ENST00000266546 TMEM181Q9P2C4 612 aa11.27□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 SNX7Q9UNH6 387 aa11.27□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 ING4Q9UNL4 249 aa11.27□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 CORO2BQ9UQ03 480 aa11.27□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa11.27□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa11.27□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 SIP14410 1827 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 JUNP05412 331 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 NR2F6P10588 404 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 VARSP26640 1264 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 HTR1EP28566 365 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 SERPINA4P29622 427 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 ALDH3B2P48448 385 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 APOFQ13790 326 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 LRP8Q14114 963 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 CILP2Q8IUL8 1156 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 RGL4Q8IZJ4 473 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 MMP27Q9H306 513 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 ABCB9Q9NP78 766 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 ITM2CQ9NQX7 267 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 TLR9Q9NR96 1032 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 SCN1AP35498 2009 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 PLOD3O60568 738 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 NPPAP01160 153 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 FYNP06241 537 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 OR56A5P0C7T3 313 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 SLC6A2P23975 617 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 GGT5P36269 586 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 GALNT12Q8IXK2 581 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 UBE2J2Q8N2K1 259 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 OR13C4Q8NGS5 318 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 LGALS12Q96DT0 336 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 ANKHQ9HCJ1 492 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 MYO7AQ13402 2215 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 ASXL3Q9C0F0 2248 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 ISPDA4D126 451 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 TRIM64CA6NLI5 447 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 B4GAT1O43505 415 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 PPIBP23284 216 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 RAB25P57735 213 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 SLC10A7Q0GE19 358 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 OR2T5Q6IEZ7 315 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 DOK6Q6PKX4 331 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF534Q76KX8 674 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 OR6K2Q8NGY2 324 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 OR2T29Q8NH02 315 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 CNIH3Q8TBE1 160 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 TRPC4Q9UBN4 977 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 ATP6V1HQ9UI12 483 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa11.26□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 STK16O75716 305 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 GJB5O95377 273 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 G6PDP11413 515 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 TUBB3Q13509 450 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 STARD3Q14849 445 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 ZSWIM7Q19AV6 140 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 SLC36A3Q495N2 470 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 MZT2AQ6P582 158 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 TBC1D15Q8TC07 691 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 ACDQ96AP0 544 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 MKLN1Q9UL63 735 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF232Q9UNY5 417 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 TESMINQ9Y4I5 508 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 ARL5AQ9Y689 179 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 HMX2A2RU54 273 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 FPGTO14772 594 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 AP2A2O94973 939 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 SNX4O95219 450 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 CAPN3P20807 821 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 BMPR1AP36894 532 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 OR4D2P58180 307 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 MXD1Q05195 221 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 LRRC26Q2I0M4 334 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 UNC50Q53HI1 259 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 CHPT1Q8WUD6 406 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 BADQ92934 168 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 TADA1Q96BN2 335 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 CNPPD1Q9BV87 410 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa11.25□□□□□ -0.61
CLSTN3-201ENST00000266546 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms