RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561817.5

CAPN3-210, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPN3, Length 915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-210ENST00000561817 OR2AG1Q9H205 316 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 IPPKQ9H8X2 491 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 SLC23A2Q9UGH3 650 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 CA14Q9ULX7 337 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 GPR34Q9UPC5 381 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 BTRCQ9Y297 605 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 STK38LQ9Y2H1 464 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 FIS1Q9Y3D6 152 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 GPR45Q9Y5Y3 372 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 KMT2EQ8IZD2 1858 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 LOC100653049A0A140TA62 436 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 SERTM1A2A2V5 107 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 KRBA1A5PL33 1030 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 MGAT4DA6NG13 374 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 MEI4A8MW99 385 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 LOC730098B7Z3J9 87 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 FBP2O00757 339 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 GYG2O15488 501 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 VPS4BO75351 444 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 STK16O75716 305 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 ATP6AP2O75787 350 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 POP7O75817 140 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 KRT34O76011 436 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 TM7SF2O76062 418 aa6.35□□□□□ -1.39
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CAPN3-210ENST00000561817 C1orf105O95561 183 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 ATP6V1G2O95670 118 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 OTCP00480 354 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 CAPN1P07384 714 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 ANXA5P08758 320 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 LINC00032P0C843 101 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 EBLN1P0CF75 366 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 ARAFP10398 606 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 THRAP10827 490 aa6.35□□□□□ -1.39
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CAPN3-210ENST00000561817 IGFALSP35858 605 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 HALP42357 657 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 ACADVLP49748 655 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 HNMTP50135 292 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 ADPRHP54922 357 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 PFN3P60673 137 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
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CAPN3-210ENST00000561817 IRF4Q15306 451 aa6.35□□□□□ -1.39
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CAPN3-210ENST00000561817 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 SFRP1Q8N474 314 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.35□□□□□ -1.39
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CAPN3-210ENST00000561817 L3MBTL4Q8NA19 623 aa6.35□□□□□ -1.39
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CAPN3-210ENST00000561817 OR56A3Q8NH54 315 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 HM13Q8TCT9 377 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 USP7Q93009 1102 aa6.35□□□□□ -1.39
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CAPN3-210ENST00000561817 OR52A5Q9H2C5 316 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 SLC32A1Q9H598 525 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 CD320Q9NPF0 282 aa6.35□□□□□ -1.39
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CAPN3-210ENST00000561817 SCML1Q9UN30 329 aa6.35□□□□□ -1.39
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CAPN3-210ENST00000561817 A0A1W2PQU0 124 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 H0YHG0 523 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 MANBAO00462 879 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 ANKRD28O15084 1053 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPN3-210ENST00000561817 LSM1O15116 133 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
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