RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MELKQ14680 651 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM132DQ14C87 1099 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TAB1Q15750 504 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DPCR1Q3MIW9 517 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM182AQ5T1J6 154 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C9orf66Q5T8R8 295 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NAA35Q5VZE5 725 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 Q6P435 159 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LCLAT1Q6UWP7 414 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GALNT5Q7Z7M9 940 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DGAT2Q96PD7 388 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAP7D2Q96T17 732 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC3Q9BQI4 270 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DPAGT1Q9H3H5 408 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 B3GAT1Q9P2W7 334 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POGZQ7Z3K3 1410 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GON4LQ3T8J9 2241 aa0.53□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRIM49BA6NDI0 452 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 E7ENQ6 273 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 K7EQG2 157 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF253O75346 499 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SH3BGRLO75368 114 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GH2P01242 217 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C9P02748 559 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ALOX5P09917 674 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDH3P22223 829 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPL21P46778 160 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RARSP54136 660 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GALCP54803 685 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DLG2Q15700 870 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC00242Q5T6M2 205 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C3P1Q6ZMU1 363 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C4orf32Q8N8J7 132 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR13C3Q8NGS6 347 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EXD1Q8NHP7 514 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GTSF1Q8WW33 167 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ITLN1Q8WWA0 313 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MTERF3Q96E29 417 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SAAL1Q96ER3 474 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RADILQ96JH8 1075 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C1orf74Q96LT6 269 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DACH2Q96NX9 599 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR2A14Q96R47 310 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR6C1Q96RD1 312 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAD9AQ99638 391 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BTBD10Q9BSF8 475 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AGXT2Q9BYV1 514 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNAJC18Q9H819 358 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NTN4Q9HB63 628 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 Q9N2K0 584 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STUB1Q9UNE7 303 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa0.51□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARHGEF33A8MVX0 844 aa0.51□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EPHB6O15197 1021 aa0.51□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OGTO15294 1046 aa0.51□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TEX28O15482 410 aa0.51□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LATO43561 262 aa0.51□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PIP5K1CO60331 668 aa0.51□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MEGF6O75095 1541 aa0.51□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SEC14L2O76054 403 aa0.51□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SEMA4FO95754 770 aa0.51□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGHG3P01860 377 aa0.51□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HIST1H2ABP04908 130 aa0.51□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UBL4AP11441 157 aa0.51□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRLRP16471 622 aa0.51□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HIST1H2ADP20671 130 aa0.51□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 JAK1P23458 1154 aa0.51□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EDNRAP25101 427 aa0.51□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FASP25445 335 aa0.51□□□□□ -2.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LMO2P25791 158 aa0.51□□□□□ -2.33
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