RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ZFP28Q8NHY6 868 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PCDH19Q8TAB3 1148 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 HEXDCQ8WVB3 486 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CCDC28BQ9BUN5 200 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 NDEL1Q9GZM8 345 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 SLC25A51Q9H1U9 297 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 DKK3Q9UBP4 350 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 KCNK6Q9Y257 313 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ACTL7AQ9Y615 435 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 TEX264Q9Y6I9 313 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 DGKBQ9Y6T7 804 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 MYOFQ9NZM1 2061 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF318Q5VUA4 2279 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 J3QRK9 145 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PDLIM1O00151 329 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 GRID2O43424 1007 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 KRT75O95678 551 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 MPOP05164 745 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 OR56A5P0C7T3 313 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CDH3P22223 829 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 DGKAP23743 735 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 STT3AP46977 705 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 GSSP48637 474 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CLK1P49759 484 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ENTPD1P49961 510 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 NXPH1P58417 271 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 RAB6CQ53S08 254 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 MANEAQ5SRI9 462 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 SCIMPQ6UWF3 145 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 XKR5Q6UX68 686 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 FAM151BQ6UXP7 276 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 AMZ2Q86W34 360 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 FAM217AQ8IXS0 508 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CBR4Q8N4T8 237 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ACTRT2Q8TDY3 377 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 DLG3Q92796 817 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 FBXL8Q96CD0 374 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 P2RY11Q96G91 374 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 SLC39A3Q9BRY0 314 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CCDC106Q9BWC9 280 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 RAB6CQ9H0N0 254 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 IL21RQ9HBE5 538 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PNPLA3Q9NST1 481 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 SERGEFQ9UGK8 458 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 RAP2CQ9Y3L5 183 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PSAT1Q9Y617 370 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 BRCA2P51587 3418 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 POM121BA6NF01 834 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 QSOX1O00391 747 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CSO75390 466 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 RFPL1O75677 317 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CLIC3O95833 236 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CHRM3P20309 590 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 SPAM1P38567 509 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 YAP1P46937 504 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 HK3P52790 923 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 FZD5Q13467 585 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 GK3PQ14409 553 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 IRF4Q15306 451 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 RGS21Q2M5E4 152 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 FOXB2Q5VYV0 432 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 MACC1Q6ZN28 852 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 LRRTM4Q86VH4 590 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 SPPL2CQ8IUH8 684 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 RELL1Q8IUW5 271 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CROCCP3Q8IVE0 287 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PLPP6Q8IY26 295 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 RBFAQ8N0V3 343 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 KCNE4Q8WWG9 221 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 SCAMP4Q969E2 229 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 FERD3LQ96RJ6 166 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ARMC7Q9H6L4 198 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CHRAC1Q9NRG0 131 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 RAB26Q9ULW5 256 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PCNX2A6NKB5 2137 aa5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms