RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 MAGP20916 626 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 CD9P21926 228 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 MCM3P25205 808 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 OAS2P29728 719 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 SSTR1P30872 391 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 SHMT2P34897 504 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 GRIA3P42263 894 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB28P51157 221 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 RPS18P62269 152 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 NFKB2Q00653 900 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ACY1Q03154 408 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ABHD18Q0P651 414 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 LY6DQ14210 128 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 MAP7Q14244 749 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF460Q14592 562 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 IL11RAQ14626 422 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 TBR1Q16650 682 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 HIF1AQ16665 826 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC5A12Q1EHB4 618 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 FIGLAQ6QHK4 219 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 UNC5DQ6UXZ4 953 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
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RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 SHISA5Q8N114 240 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2A1Q8NGT9 310 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 OR9A1PQ8NGU1 263 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2L8Q8NGY9 312 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXO25Q8TCJ0 367 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 CT55Q8WUE5 264 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 EXTL1Q92935 676 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 RUNDC3BQ96NL0 473 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ZPBPQ9BS86 351 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.75□□□□□ -1.33
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RABGEF1-206ENST00000461017 LHX9Q9NQ69 397 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 SOHLH2Q9NX45 425 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 OR6C2Q9NZP2 312 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 WHRNQ9P202 907 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 CDC23Q9UJX2 597 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 RARRES3Q9UL19 164 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 KALRNO60229 2985 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ESYT3A0FGR9 886 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 E5RI56 91 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 H3BMM5 538 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 MYO1CO00159 1063 aa6.74□□□□□ -1.33
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF749O43361 778 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 CTSVO60911 334 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
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RABGEF1-206ENST00000461017 TTC4O95801 387 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 TSPAN12O95859 305 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 MSL3P1P0C860 447 aa6.74□□□□□ -1.33
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RABGEF1-206ENST00000461017 ITGAXP20702 1163 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP5DP30049 168 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 RORAP35398 523 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 CBSP35520 551 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 DLSTP36957 453 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 GCGRP47871 477 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 PLTPP55058 493 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 UCNP55089 124 aa6.74□□□□□ -1.33
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RABGEF1-206ENST00000461017 TUBB4BP68371 445 aa6.74□□□□□ -1.33
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RABGEF1-206ENST00000461017 TUBB2AQ13885 445 aa6.74□□□□□ -1.33
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RABGEF1-206ENST00000461017 CYP2A13Q16696 494 aa6.74□□□□□ -1.33
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZBED8Q8IZ13 594 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 DSELQ8IZU8 1212 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 PDIK1LQ8N165 341 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 CALML6Q8TD86 181 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ASB11Q8WXH4 323 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF592Q92610 1267 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNJ9Q92806 393 aa6.74□□□□□ -1.33
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