RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419253.1

TTC28-AS1-203, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 846 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CPNE9Q8IYJ1 553 aa11.97□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MYO1HQ8N1T3 1032 aa11.97□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LINC01555Q8NAE3 123 aa11.97□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR1L3Q8NH93 324 aa11.97□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CD200R1Q8TD46 325 aa11.97□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SMPDL3AQ92484 453 aa11.97□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 STARD8Q92502 1023 aa11.97□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SEC14L1Q92503 715 aa11.97□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CDKL2Q92772 493 aa11.97□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZUFSPQ96AP4 578 aa11.97□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GPR87Q9BY21 358 aa11.97□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa11.97□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SAYSD1Q9NPB0 183 aa11.97□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TXLNGQ9NUQ3 528 aa11.97□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TXNDC16Q9P2K2 825 aa11.97□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PLCL2Q9UPR0 1127 aa11.97□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IGSF10Q6WRI0 2623 aa11.97□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CACNA1GO43497 2377 aa11.97□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SPTBP11277 2137 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARHGEF33A8MVX0 844 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MEN1O00255 615 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF749O43361 778 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCNDBP1O95273 360 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SFTPCP11686 197 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 WT1P19544 449 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HIST1H2ADP20671 130 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MAGP20916 626 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CMPK1P30085 196 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PLTPP55058 493 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CYP2A13Q16696 494 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DEFB110Q30KQ9 67 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCSMST1Q4G0I0 132 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 STEAP4Q687X5 459 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DUPD1Q68J44 220 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM45BPQ6NSW5 357 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C8orf74Q6P047 294 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TLDC1Q6P9B6 456 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BORAQ6PGQ7 559 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FIGLAQ6QHK4 219 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CAPN12Q6ZSI9 719 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM20CQ8IXL6 584 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SYTL1Q8IYJ3 562 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MNS1Q8NEH6 495 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HMGCLL1Q8TB92 370 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM45AQ8TCE6 357 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MCOLN3Q8TDD5 553 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DENND1AQ8TEH3 1009 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CT55Q8WUE5 264 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EXTL1Q92935 676 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LRFN5Q96NI6 719 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC30A3Q99726 388 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MIPEPQ99797 713 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HIST1H2AJQ99878 128 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C17orf62Q9BQA9 187 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 H2AFJQ9BTM1 129 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NDC1Q9BTX1 674 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MENTQ9BUN1 341 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC12A9Q9BXP2 914 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM60AQ9NP50 221 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ABCF3Q9NUQ8 709 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IL17BQ9UHF5 180 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 VWA7Q9Y334 891 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TARM1B6A8C7 271 aa11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C9J4A7 227 aa11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 E7ESA3 106 aa11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MYO1CO00159 1063 aa11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NKX2-8O15522 239 aa11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C8GP07360 202 aa11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SAT1P21673 171 aa11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCR10P46092 362 aa11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PNLIPRP1P54315 467 aa11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC12A2P55011 1212 aa11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IL2P60568 153 aa11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CDC20Q12834 499 aa11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ERV3-1Q14264 604 aa11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZIC1Q15915 447 aa11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TBR1Q16650 682 aa11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HECTD2Q5U5R9 776 aa11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PAQR3Q6TCH7 311 aa11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 STRA8Q7Z7C7 330 aa11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC26A11Q86WA9 606 aa11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCDC25Q86WR0 208 aa11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.5 ms