RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580654.5

SMARCE1-217, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-217ENST00000580654 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 HES7Q9BYE0 225 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 UGT1A7Q9HAW7 530 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 UGT1A10Q9HAW8 530 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 UGT1A8Q9HAW9 530 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 MAGEE1Q9HCI5 957 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM8A1Q9UBU6 413 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 RWDD2AQ9UIY3 292 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 ACSL5Q9ULC5 683 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 RNF6Q9Y252 685 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 L3MBTL1Q9Y468 752 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 TLN2Q9Y4G6 2542 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 A0A1B0GX78 115 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 A0A1W2PQ72 361 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 INAFM1C9JVW0 142 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 MAP2K7O14733 419 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 KLK8O60259 260 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 MED26O95402 600 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 POLBP06746 335 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC35G4P0C7Q5 338 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 ITGAMP11215 1152 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 FDXRP22570 491 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 MCM3P25205 808 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 NSG1P42857 185 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 KLK7P49862 253 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF165P49910 485 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 ARSEP51690 589 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 DGKQP52824 942 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 KLC1Q07866 573 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 DEFB113Q30KQ7 82 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 FNBP1LQ5T0N5 605 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 GPRC6AQ5T6X5 926 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 ACAD10Q6JQN1 1059 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 PAMR1Q6UXH9 720 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 NDUFAF7Q7L592 441 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 DET1Q7L5Y6 550 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 CAMKMTQ7Z624 323 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 AMIGO1Q86WK6 493 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 CDC20BQ86Y33 519 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 RPRMLQ8N4K4 120 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 CNTD1Q8N815 330 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 PHC3Q8NDX5 983 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 MDS2Q8NDY4 140 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 ASB5Q8WWX0 329 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 FATE1Q969F0 183 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 FRMD6Q96NE9 622 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 TTC25Q96NG3 672 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 FERD3LQ96RJ6 166 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 CRB3Q9BUF7 120 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 ADGRE3Q9BY15 652 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 GPR63Q9BZJ6 419 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 CLSTN2Q9H4D0 955 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 IL26Q9NPH9 171 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 RASSF1Q9NS23 344 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 FANCLQ9NW38 375 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 SPHK1Q9NYA1 384 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 EURLQ9NYK6 297 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 TAS2R14Q9NYV8 317 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 IL17CQ9P0M4 197 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 AMACRQ9UHK6 382 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 ICKQ9UPZ9 632 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 TMEM191CA6NGB0 347 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM171A2A8MVW0 826 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 DSCR3O14972 297 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 ATE1O95260 518 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 TSPAN12O95859 305 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 TPBGLP0DKB5 382 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 CCNCP24863 283 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 CHRNB4P30926 498 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 SERPINB6P35237 376 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 ARL4AP40617 200 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 ST13P50502 369 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 KRT33BQ14525 404 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 TFDP3Q5H9I0 405 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 LDLRAP1Q5SW96 308 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 NEK10Q6ZWH5 1172 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 CHSY3Q70JA7 882 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 LRRC49Q8IUZ0 686 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 ZZZ3Q8IYH5 903 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 PRSS58Q8IYP2 241 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 CFAP206Q8IYR0 622 aa7.31□□□□□ -1.24
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