RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM116Q8NCL8 245 aa0.55□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa0.55□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR4Q3Q8NH05 313 aa0.55□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AGAP11Q8TF27 550 aa0.55□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IRGQQ8WZA9 623 aa0.55□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF799Q96GE5 643 aa0.55□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CALML4Q96GE6 196 aa0.55□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM81BQ96LP2 452 aa0.55□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPAG5Q96R06 1193 aa0.55□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RANBP9Q96S59 729 aa0.55□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GAD1Q99259 594 aa0.55□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATF6BQ99941 703 aa0.55□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PITPNM3Q9BZ71 974 aa0.55□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 JPT2Q9H910 190 aa0.55□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HHATLQ9HCP6 504 aa0.55□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FGF21Q9NSA1 209 aa0.55□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLEC5AQ9NY25 188 aa0.55□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR6C2Q9NZP2 312 aa0.55□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CACNG4Q9UBN1 327 aa0.55□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYH15Q9Y2K3 1946 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FEZF1A0PJY2 475 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HYKKA2RU49 373 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLEKHD1A6NEE1 506 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TTC36A6NLP5 189 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SNURFLB1AK76 121 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 K7ENM7 598 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OGG1O15527 345 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GLRA3O75311 464 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC25A12O75746 678 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CNTFP26441 200 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TSFMP43897 325 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAZP56270 477 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HERV-K104P61576 105 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF415Q09FC8 603 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ITPK1Q13572 414 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDH18Q13634 790 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF146Q15072 292 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPR68Q15743 365 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BAK1Q16611 211 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MS4A18Q3C1V0 323 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C20orf194Q5TEA3 1177 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UGT3A1Q6NUS8 523 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PAMR1Q6UXH9 720 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HAUS6Q7Z4H7 955 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VASH2Q86V25 355 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARHGAP24Q8N264 748 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POC5Q8NA72 575 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NPEPL1Q8NDH3 523 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR5M8Q8NGP6 311 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NFKBIDQ8NI38 313 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NSMAFQ92636 917 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ERLEC1Q96DZ1 483 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNF125Q96EQ8 232 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ELMOD3Q96FG2 381 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHRDL1Q9BU40 450 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HES7Q9BYE0 225 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HOXD1Q9GZZ0 328 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLSCR3Q9NRY6 295 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TBX20Q9UMR3 447 aa0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP0.54□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANKRD61A6NGH8 418 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPL37AP8A6NKH3 93 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ENO4A6NNW6 628 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TSPAN4O14817 238 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NDUFS4O43181 175 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CREG1O75629 220 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POLBP06746 335 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM200BP0CF97 657 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCP11498 1178 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PDX1P52945 283 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RIPK4P57078 832 aa0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms