RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494395.1

ITGB1-217, Transcript of integrin subunit beta 1, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB1, Length 562 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1-217ENST00000494395 OR4E2Q8NGC2 313 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 FBXO25Q8TCJ0 367 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 LCN9Q8WX39 176 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 KCNJ9Q92806 393 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 USP7Q93009 1102 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 ZDHHC12Q96GR4 267 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 ABHD17AQ96GS6 310 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 PPM1MQ96MI6 270 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 CD180Q99467 661 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 MAP3K3Q99759 626 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 DDA1Q9BW61 102 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 GSX2Q9BZM3 304 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 SPRY4Q9C004 299 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 FBXO8Q9NRD0 319 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 HRASLS2Q9NWW9 162 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 MOCS1Q9NZB8 636 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 KLHL42Q9P2K6 505 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 SLC17A6Q9P2U8 582 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 KLHL3Q9UH77 587 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 ASF1AQ9Y294 204 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 NFS1Q9Y697 457 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 PKD1L2Q7Z442 2459 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 LAMA5O15230 3695 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 LCE2BO14633 110 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 MATN4O95460 622 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 AHSGP02765 367 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 NELFEP18615 380 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 ITPKBP27987 946 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 PKLRP30613 574 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 MAPK10P53779 464 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 CALCOCO2Q13137 446 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 TUBB2AQ13885 445 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 TMED2Q15363 201 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 KYNUQ16719 465 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 ACSBG2Q5FVE4 666 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 CACHD1Q5VU97 1274 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 IRGCQ6NXR0 463 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 FAM92BQ6ZTR7 304 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 KIAA0408Q6ZU52 694 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 OTOAQ7RTW8 1153 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 AMIGO1Q86WK6 493 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 KMT5CQ86Y97 462 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 SPACA3Q8IXA5 215 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 CARFQ8N187 725 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 ZNF248Q8NDW4 579 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 FBXO36Q8NEA4 188 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 CD200R1Q8TD46 325 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 FBF1Q8TES7 1133 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 UBXN4Q92575 508 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 CFAP36Q96G28 342 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 TAAR9Q96RI9 348 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 LRRC1Q9BTT6 524 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 TUBB2BQ9BVA1 445 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 PITPNM3Q9BZ71 974 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 RAB17Q9H0T7 212 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 SRMSQ9H3Y6 488 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 XKR8Q9H6D3 395 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 APMAPQ9HDC9 416 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 POLG2Q9UHN1 485 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 BTRCQ9Y297 605 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 DHRS7Q9Y394 339 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 COMMD10Q9Y6G5 202 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 CACNA1BQ00975 2339 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 PCM1Q15154 2024 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 KRT87PA6NCN2 255 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 MATN2O00339 956 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 C1orf105O95561 183 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 DLGAP3O95886 979 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 ERGP11308 486 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 CD9P21926 228 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 CD82P27701 267 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 SHMT2P34897 504 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 CARSP49589 748 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 SEPHS1P49903 392 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 CDKN2DP55273 166 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 GPX6P59796 221 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB1-217ENST00000494395 SLC7A5Q01650 507 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.8 ms