RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492737.5

CACNB1-204, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 1, humanhuman

TSL 3

Gene CACNB1, Length 588 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1-204ENST00000492737 PTGIRP43119 386 aa9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 PMS2P54278 862 aa9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 SARNPP82979 210 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 C1orf189Q5VU69 101 aa9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 ZNF470Q6ECI4 717 aa9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 ATG14Q6ZNE5 492 aa9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 CENPUQ71F23 418 aa9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 OTOAQ7RTW8 1153 aa9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 LRRC6Q86X45 466 aa9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 GPR135Q8IZ08 494 aa9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 OR2L8Q8NGY9 312 aa9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 GSDMBQ8TAX9 411 aa9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 TCTN2Q96GX1 697 aa9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 GPR87Q9BY21 358 aa9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 TRIM55Q9BYV6 548 aa9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 IRAK4Q9NWZ3 460 aa9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 SAMD15Q9P1V8 674 aa9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 GALPQ9UBC7 116 aa9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 SERTAD3Q9UJW9 196 aa9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 SNX7Q9UNH6 387 aa9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 CRYL1Q9Y2S2 319 aa9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 TENM4Q6N022 2769 aa9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 PCM1Q15154 2024 aa9.6□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 USP27XA6NNY8 438 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 MKRN2OSH3BPM6 223 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 KPNA5O15131 536 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 ZSCAN12O43309 604 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 C1orf105O95561 183 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 ESR1P03372 595 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 RAB40ALP0C0E4 278 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 CBSLP0DN79 551 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 MLNP12872 115 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 PAMP19021 973 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 CBSP35520 551 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 SLC1A2P43004 574 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 FNTAP49354 379 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 TLE1Q04724 770 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 GBX1Q14549 363 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 SLC9A5Q14940 896 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 CILP2Q8IUL8 1156 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 DENND6AQ8IWF6 608 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 HOMEZQ8IX15 550 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 DNAJC22Q8N4W6 341 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 ZBTB2Q8N680 514 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 NAT8LQ8N9F0 302 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 MCUQ8NE86 351 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 ACTRT1Q8TDG2 376 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 SEC14L1Q92503 715 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 NLNQ9BYT8 704 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 EPN3Q9H201 632 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 TLK1Q9UKI8 766 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 TCFL5Q9UL49 500 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 SLC39A10Q9ULF5 831 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 SNX12Q9UMY4 172 aa9.59□□□□□ -0.87
CACNB1-204ENST00000492737 SEC16AO15027 2179 aa9.58□□□□□ -0.88
CACNB1-204ENST00000492737 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa9.58□□□□□ -0.88
CACNB1-204ENST00000492737 SDR42E2A6NKP2 422 aa9.58□□□□□ -0.88
CACNB1-204ENST00000492737 C9J4A7 227 aa9.58□□□□□ -0.88
CACNB1-204ENST00000492737 E5RI56 91 aa9.58□□□□□ -0.88
CACNB1-204ENST00000492737 PFDN6O15212 129 aa9.58□□□□□ -0.88
CACNB1-204ENST00000492737 KIF5CO60282 957 aa9.58□□□□□ -0.88
CACNB1-204ENST00000492737 NRP2O60462 931 aa9.58□□□□□ -0.88
CACNB1-204ENST00000492737 BANF1O75531 89 aa9.58□□□□□ -0.88
CACNB1-204ENST00000492737 WISP1O95388 367 aa9.58□□□□□ -0.88
CACNB1-204ENST00000492737 S1PR4O95977 384 aa9.58□□□□□ -0.88
CACNB1-204ENST00000492737 RECKO95980 971 aa9.58□□□□□ -0.88
CACNB1-204ENST00000492737 PDGFAP04085 211 aa9.58□□□□□ -0.88
CACNB1-204ENST00000492737 HBQ1P09105 142 aa9.58□□□□□ -0.88
CACNB1-204ENST00000492737 PKMP14618 531 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CACNB1-204ENST00000492737 CHRM3P20309 590 aa9.58□□□□□ -0.88
CACNB1-204ENST00000492737 MAGEA3P43357 314 aa9.58□□□□□ -0.88
CACNB1-204ENST00000492737 FOXL2P58012 376 aa9.58□□□□□ -0.88
CACNB1-204ENST00000492737 CTBP1Q13363 440 aa9.58□□□□□ -0.88
CACNB1-204ENST00000492737 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CACNB1-204ENST00000492737 NCF4Q15080 339 aa9.58□□□□□ -0.88
CACNB1-204ENST00000492737 PPP1R7Q15435 360 aa9.58□□□□□ -0.88
CACNB1-204ENST00000492737 ACSBG2Q5FVE4 666 aa9.58□□□□□ -0.88
CACNB1-204ENST00000492737 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CACNB1-204ENST00000492737 FCRL6Q6DN72 434 aa9.58□□□□□ -0.88
CACNB1-204ENST00000492737 RHBDD2Q6NTF9 364 aa9.58□□□□□ -0.88
CACNB1-204ENST00000492737 NEPROQ6NW34 567 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms