RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATAT1Q5SQI0 421 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRSS58Q8IYP2 241 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VRTNQ9H8Y1 702 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VPS29Q9UBQ0 182 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAJB9Q9UBS3 223 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1B0GUL6 1792 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYO10Q9HD67 2058 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EDIL3O43854 480 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NME6O75414 186 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 QPRTQ15274 297 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SFT2D3Q587I9 215 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMARCD3Q6STE5 483 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZZZ3Q8IYH5 903 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBE2J2Q8N2K1 259 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SRRDQ9UH36 339 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WNT6Q9Y6F9 365 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC25A12O75746 678 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SNX4O95219 450 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACP5P13686 325 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VARSP26640 1264 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C1QTNF8P60827 252 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AMZ2Q86W34 360 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HM13Q8TCT9 377 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C8orf48Q96LL4 319 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FCRL4Q96PJ5 515 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STRA6Q9BX79 667 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 E7ESA3 106 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WNT9AO14904 365 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PI15O43692 258 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ALAS2P22557 587 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYL9P24844 172 aa16.23■□□□□ 0.19
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP16.23■□□□□ 0.191e-6■■■■□ 24.4
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARNTL2Q8WYA1 636 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC38A4Q969I6 547 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FRG2BQ96QU4 278 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COPS4Q9BT78 406 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLHL31Q9H511 634 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MCUBQ9NWR8 336 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GABRQQ9UN88 632 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC22A2O15244 555 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR1I1O60431 355 aa16.23■□□□□ 0.19
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GADD45GO95257 159 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GJB5O95377 273 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRMT2P55345 433 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DAG1Q14118 895 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TGFBIQ15582 683 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IFI44LQ53G44 452 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GDPD4Q6W3E5 623 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM220AQ7Z4H9 259 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLIP4Q8N3C7 705 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CPA6Q8N4T0 437 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR10T2Q8NGX3 314 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CEP295NLQ96MC4 621 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPL10P27635 214 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SERINC3Q13530 473 aa16.23■□□□□ 0.19
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM138Q9NPI0 162 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HERC3Q15034 1050 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TPGS2Q68CL5 300 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HERVK_113Q902F9 699 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMBIM1Q969X1 311 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADAP2Q9NPF8 381 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TVP23BQ9NYZ1 205 aa16.23■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1W2PRB8 838 aa16.22■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCT3P49368 545 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RHDQ02161 417 aa16.22■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPRED3Q2MJR0 410 aa16.22■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF461Q8TAF7 563 aa16.22■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IL4I1Q96RQ9 567 aa16.22■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC32A1Q9H598 525 aa16.22■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LCHNA4D1U4 455 aa16.22■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM86C2PA6NEL3 165 aa16.22■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC14BA6NHZ5 514 aa16.22■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERVK-21P61565 698 aa16.22■□□□□ 0.19
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