RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 CYP2A7P20853 494 aa14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC5A2P31639 672 aa14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1CAP62136 330 aa14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 ACY1Q03154 408 aa14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 FOXM1Q08050 763 aa14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 SP140Q13342 867 aa14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 IL11RAQ14626 422 aa14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 SPESP1Q6UW49 350 aa14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 CEACAM20Q6UY09 585 aa14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 CYHR1Q6ZMK1 362 aa14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 PROSER1Q86XN7 944 aa14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 HMGCLL1Q8TB92 370 aa14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 LINGO1Q96FE5 620 aa14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 RBBP8Q99708 897 aa14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 HIST1H2AJQ99878 128 aa14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 H2AFJQ9BTM1 129 aa14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 PITPNM3Q9BZ71 974 aa14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 PDE7BQ9NP56 450 aa14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 SOHLH2Q9NX45 425 aa14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 PMS2P1A4D2B8 440 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 PIAS1O75925 651 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 SYF2O95926 243 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 UGT2B7P16662 529 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 ECHS1P30084 290 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 ETV5P41161 510 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 TAS2R39P59534 338 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 GRB7Q14451 532 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 USP10Q14694 798 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC5A12Q1EHB4 618 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 D2HGDHQ8N465 521 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 BMPERQ8N8U9 685 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF248Q8NDW4 579 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 OR8K5Q8NH50 307 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 SMPDL3AQ92484 453 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKRD7Q92527 254 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 IL17FQ96PD4 163 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2A14Q96R47 310 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 OLFM1Q99784 485 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 MCMBPQ9BTE3 642 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC12A9Q9BXP2 914 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 ACSS3Q9H6R3 686 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 PARVBQ9HBI1 364 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 ACSL6Q9UKU0 697 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 IKBKGQ9Y6K9 419 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 SEC16AO15027 2179 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A0J9YY10 115 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 PRAMEF10O60809 474 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 SLU7O95391 586 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 ACSL3O95573 720 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 STMN1P16949 149 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 NAA25Q14CX7 972 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 CYP2A13Q16696 494 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 TCTN2Q96GX1 697 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 FCRL4Q96PJ5 515 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 OR6C1Q96RD1 312 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 GPR22Q99680 433 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 MENTQ9BUN1 341 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 FUT8Q9BYC5 575 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 TWSG1Q9GZX9 223 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 FANCEQ9HB96 536 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 GPAMQ9HCL2 828 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 SPHK1Q9NYA1 384 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 CIDEBQ9UHD4 219 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 RARRES3Q9UL19 164 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 BTRCQ9Y297 605 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 C9orf172C9J069 976 aa14.86□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 C1QAP02745 245 aa14.86□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 OAS2P29728 719 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 TUBB3Q13509 450 aa14.86□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 CCSMST1Q4G0I0 132 aa14.86□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 TAOK1Q7L7X3 1001 aa14.86□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC91Q7Z6B0 441 aa14.86□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1R3BQ86XI6 285 aa14.86□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 RASGRP3Q8IV61 690 aa14.86□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 SYTL1Q8IYJ3 562 aa14.86□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 CNPY4Q8N129 248 aa14.86□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC01555Q8NAE3 123 aa14.86□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 LRRN4CLQ8ND94 238 aa14.86□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC138Q96M89 665 aa14.86□□□□□ -0.03
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